Basic Information

Symbol
hsa_EIF3J_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EIF3J_0017
Host gene
EIF3J
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
15:44846751-44848217 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:44554553-44556019 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-395.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -425.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 432.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.......................))))(................((((.....))))((((((..........(((((((((((((((.(..((((.((((((((..((((((.(((.(((..............(((((.....)))))....(((....))).((((((...(((.....)))..))))))....((((((...((..((((((....))))))..))..))))))((((((...........))))))(((..((((((((((....)))))))..)))..))).........(((((((((((((...........((((...(((((((((((((.((.(...((((.((((((((((...((((((..........(((.(((((........((((...)))).((.(((((((((.......)).))))))).))((((((((((((........)))))))))))).....))))).)))(((((..(((((....)))))))))).))))))..))))).)))))..))))).)))))).))))))))).....(((((........)))))((((((.((.....(((((((.((((..(((((((((((.(.((((((..((((..(((((((((.(((((((((.....(((((.....((((.((.(...((((((......))))))...).)).))))))))).......)))))....((((((((.....((((((((((((.((....(((((((((((......))))................((((.(((....))).))))................))))).))..))))))))))))))....)))))))).(((((((((((..(((((((((((..((((((........)))))).((.((((((((((((....(((((((((((..........))))))).........)))).....))))))))..))))))(((.((((....)))))))....(((((((.((((.(((((((.(((((...((((((.(((((..(...........)..))))).)))........)))......)))))...))))))).)))))))).))))))))..))))))..)))...)))))))).)))).)))))))))))))....)))))).).)))))....))))))))))))))))).................)).)))))).........))))))))))))))))).....))).)))..))))))..)))))))).))))).))))))))))))....)))((((.(((((.(((((((((....)))).)))))...)))))))))...(((....)))...........))))))(((((......)))))...((((((..........)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{...............{,...{{{|||||.,,,,...........((((.....))))(((((({(........(((((((((((((((,{..((({,((((({{{.,||||{|,|{{,|||.{{.,|||{{,...(((((.....)))))....(((....))).{({{{{...(((,,...}}}..))))))....{(((((.,.((..((((((....})))))..)).})))))){(((((...........)))))}(((..((((((((({....}))))))..)))..))){{,,,.,,,((({{{{{{{{{|,.,,,,,.,,.{{{|...(((((((((((((.((.{...((((.((((((((((...((((((......,,..{((.((({(.,,..,{(((((...)))))}|.{{{{{||||..,..,.)}.}}},}||{|}((((((((((((........))))))))))))..,,}))))).)}}(((((,.{((((....)))))))))),})))))..))))).)))))..))))}.}})))).))))))))).....{((((........))))|{||||||||||||||||||||||||,,|||{{||||||||,,{{{{,,...{{({{{{((((,((..((((({{{..{{,,.{{{,,,,.,|||.,{,|,},|(((((......)))))}.,||.}},|||||,,,,..,,,.,|||{.{{{{((((((((...,,((((((((((({,((....{,(((({((((......))))......,,,,,..{{,,(,,...|}}}.))),}.,,,...............))))).},..)))))))))))))).,,.)))))))).||||,||||||,.||{{((((((.....}})))},..},}|,)))),||}{{||||||||||}|....,,(((((((..........))))))),{,,,....||||{{|||||||||,}..})))),(((.((((....))))))),..,{{||{{||{{{{,(((((((.({{({.,,{{,,{{.(((((,.,.,.........,,.))))).)||{{{.....,,}}},..,)))}),,.}))}}}),))))}}}}.}}}},)))}....,}),})}}}||}}|||}},,{{{{{{|||,,,,{{{{{{{.{(({{|........,}}}})),))).)))).,))))}})))}.....,,},.,)),}}))))}}},,.,},))}}))))))))))))),....}}}.}})..))))))..)))))))).)))),.))))))))))))....,,,((((.(((((.(((((((((....)))).)))))...))))))))).,}(({....))).,,},.....,})))))(((((......)))))...((((((.........,)))))))
Forensic Context

No forensic context available.