Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0063478 hsa_circEP300_001
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41488614-41537226 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41092610-41141222 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-818.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -864.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 679.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Forensic Context

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