Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116606 hsa_circEP300_004 hsa-EP300_0013
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41513191-41526007 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41117187-41130003 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-380.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -404.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 322.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((....(((((((((((.((..((.(((((((((....................(((((......)))))((.(.((((....)))).).))......((((((........))))))(((((((((..(((........))).))))..))))).))))))))).))..(((((((((...)))).)))))..)))))))))))))...)))).(((..((((((..((((.((((((..(((((((((((..........)))))..)))...)))..))))((((((((((((.((((......)))).))).....(((((((.......))))).))((((((((((..............(((((....((((((((((((.....((....))...)))...)))))).)))...))))).))))))))))(((((.((..(...)..)).)))))..))))))).)).)).))))..)))).)).))).(((((((((((.....((.((.(((...((((....))))..(((((((((.(((..(((..((((((........))))))....((((.(((((((((...(((((((((((((.....))))))))...((((..((.....))..)))))))))(((((....))))).........(((((((((((....(((((((((.....)))).)))))(((....(((.....)))...)))............(((((.....)))))......((((.(((((.....)))))))))......((((.........))))..((((.((........))))))(((.((((((..(((((.....))))).))))))))).....)))).))))).))(((((..(((.....))).)).)))))))))))))))).....))).)))))))))))).))).))..))...((((((((.(..((...))..))))))))))))))))..........((((........))))((((((((((((.(..(((((...))))).).)))))...((((((((((((.(...............).))))))..)))))).((((....))))..)))))))....)))).)))))((((.((((.......)))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((({,..(((((((((((.{(,.(({(((((((((,..,,,,{,....{{{{...(((((......))))),}}|}{|{{.,,,)))}.}..,......((((((........))))))(((((((((..(((........))).))))..))))).))))))))),}|{{((({((((,...}))).))))),}}}))))))))))}...||||,{{(,|((({{,..{{{{.{,{({(,,(({(((((({{........,,|}}}...|||...}}}..}}}}|,|||||||||{{((((,...,|)))}.||||.,..(((((((.......))))).))((((((((((.....,.....|..((({(....((({(((({{{(.....{{....}}...,},..,)))))).))}.,,))))}.))))))))))(((((.{{..,...}..)}.)))))..,}}}}}}.}}..}.}|}}..,}}),)}.)})}(((((((((((....,((,((,({{...((((....))))..|||||{{||.{{{.{((.{{((({{,.,,},},})}))}||||||,,..)))|||,{,...(((((((((((((.....)))))))),,,((((..((.....))..)))},)),,(((((....)))))........,|||{|((({({.,.,(((((((((.....}))).)))))|{{..,{(({.....))).,,}}}............(((((.....)))))......((({,(((((.....))))})))).....,{(|,,......,.}})),,(((({({........))))))(((.((((((..(((((.....))))).))))))))).....|))).}}}}|,|,{({,,..|||,.,,..,}.},,||||||||}|}},,||{..||....,})}))}})))}.))),)),,))...{(((((((.(..((...))..))))))))))))))}).,........{{{{........}))}((((((((((((.{..(((({...})))).,.)))))...((((((((((((.{...............,.))))))..)))))).((((....))))..))))))).,.,))}).}))))((((.((((.......)))).))))
Forensic Context

No forensic context available.