Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0002100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116608 hsa_circEP300_006 hsa-EP300_0015
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41513191-41537226 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41117187-41141222 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-593.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -633.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 452.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((.(((((.((((((((((((((.((..((.(((((((((....................(((((......)))))((.(.((((....)))).).))......((((((........))))))(((((((((..(((........))).))))..))))).))))))))).))..(((((((((...)))).)))))..)))))))))))))...((((.....))))..........((((((((((.((((((.......((.((((((.........)))).)).)).((((((.(((.((((......)))).))).(((.(((((((.......))))).))..)))...(((((.((((..((......))..)))))))))..(((((..((((((...((((((....(((......)))((((..(((((((((.((((..((((.(((((..............((((((...((((.....(((.((..(....((((((((.....((.((.(((...((((....))))..(((((((((.(((..(((..((((((........))))))....((((.(((((((((...(((((((((((((.....))))))))...((((..((.....))..)))))))))(((((....))))).........(((((((((((....(((((((((.....)))).)))))(((....(((.....)))...)))............(((((.....)))))......((((.(((((.....)))))))))......((((.........))))..((((.((........))))))(((.((((((..(((((.....))))).))))))))).....)))).))))).))(((((..(((.....))).)).)))))))))))))))).....))).)))))))))))).))).))..))...((((((((.(..((...))..)))))))))))))))).)......)..)))))..)))).)))))).............(((((...)))))....(((((((((.((((.(((.(.((((.((.(((((...))))))).))))(((.((((....)))).)))(((.((((...((((((..((((.((((.......)))).))))...))))))..))))))).((((((.((.((....)).))...((((((((((((....(((((((........((((......)))).)))))))..)))).)))).))))((((((.......))))))((((((..(..(((.((...(((...((((.((....(((((((((......................))).))))))..((((.....)))).))))))...)))...)).)))..).))))))..(((((((..((((.(((((..(....)..)))))(((((........)))))..............))))..)))))))....))))))....).))).))))))))))))).)))))..))))..))))....))))).))))..))))((((((...........))))))..(((((((..........)))))))...))))))))))))....))))).)))))).....((((.((((..((((..((((((...))).)))..)))))).....((((((.....(((((((......(((((((....((((...(((((..........)))))))))..)).)))))...)))))...((((...)))).)).....))))))........)).)))).))))))...(((((.(((((((((..((.....))..))))).))))..)))))....))))))))))........))).))))).))..((((.....)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{,(((((.(({(((((((((((.{(.,(({{((((((((,..,,,,{,....{{{{...(((((......))))),}}|}{|{{..,,)))}.}.,,......((((((........))))))(((((((((..(((........))).))))..))))).))))))))),)|,,(((((((({...}))).))))).))})))))))))))...||{{,...,)}||,....{{{{{{{{{{(((((,(((((,........,,{(({{,...,.},..}),}.,.((((((({{((,,{{{(((.....})))),|{({.,,.(((((((.......))))).))..,}||,.(,{{..||.},..},,,)),,,...)))))))))).{(((((,,.......((((((.((.(((((.({....((((..(((((((((.((((..((((.(((({..............((((((...((({....,((,{((..{,,..{(((((((.....((.((.(((...((((....))))..(((((((({,(({.{((.{{((({{,.,,,,,,,)}|}||{{{{,,,..||||||,{{,..(((((((((((((.....)))))))),,,((((..((.....))..)))},)),,(((((....))))).........{{(((((((((.,..(((((((((.....)))).))))){{{..,{(((.....))).,,,}}............(((((.....)))))......((({,(((((.....))))))))).....,(((,,........),)),,((((,({........))))))(((.((((((..(((((.....))))).))))))))).....)))).))))).}}{({{{,,|||,....,,,.},,))))))}})))},}}},..,,,,..}))))))))))).))).))..))...((((((((.(..((...))..)))))))))))))))).}..,,..}..)))}),,)))).))))))..,,{{{{.....||||,,..,}}}}.,{.(((((((((.((((.(((,{.((((.((.(((({...})))))).))))(((.((((....)))).)))(((.((((...((((((.{((((.((((.......)))).)))).,.))))))..))))))).((((((.{{,((....|}.||.,,((((((((((((,,,.(((((((.........,.,.....})),).))))))),.)))},)))).)))}{(((((.......)))))}((((((..,..(((.((...(((...((((.{,....(((((((((......................))},))))))..((((.....)))).))))))...)))...)).)))..).))))))..{||||||..{|||.{((((,,{..,.}..))}))(((((........)))))..,{,,||,,...,)}))..})))})}....))))))..}}).))}.)))))))))))))})))))..))))..))))....))))).))))..))))((((((...........))))))..(((((((.,,.....,.)))))))......)).))))).))...))))))..,...,..))))},..{{,.{(((..((((({...})).)))..)))}||.}}}}||||||.....|}|||{{..{{{{(((((((....((((...(((((..........)))))))))..)).))))).||))|,|...,{({...}}}}}},,....},)))),,,.........({{{{{..||.,,{.((((.....}}}}......,,})}.,)}|.)))}}),.}}))}|.|,,,}})))))),,..,.}}))).})))).,...{{{{.....)))).
Forensic Context

No forensic context available.