Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0005200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0063483 hsa_circEP300_017 hsa-EP300_0064
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41521868-41546202 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41125864-41150198 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-605.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -644.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 478.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..((.....))..)))).....(((((....)))))......((((((((.....)))..(((((((((.....)))).))))))))))(((((.....))).)).........(((...(((((.....)))))....)))((((...(((.(((((((..(((((...))))).......((((....((((.((........))))))(((.((((((..(((((.....))))).))))))))).....)))).....((..(((....)))..))..(((((.((((((((((....(((..((........))..)))..)))))))))).....((((((((((((.((((.((..........)).))))........((((........))))((((((((((((.(..(((((...))))).).)))))...((((((((((((.(...............).))))))..)))))).((((....))))..)))))))..((..((((((..((((.((((.......)))).))))...))))))..)).((((..(((((....((((..(((((....)))))(((((.......(((((((.............(((.....))).....(((.((((.(((((.......))))).))))...))).(((........)))....(((.((((((.....((((((((((.(((.................((((((((((.......))).)))).)))..((((((((((.......)))).....)))))).......((((((((((((.....((((..(((((........)))))..)))).((((((..(((................))).))))))....((.((..(.((((.....)))).)..)).))..((((((....((.((((....))))....(((((..(((((((((..........((((((..........)))))).........))))....))))).)))))......)).....)))))).......((((..((.(((((......(((((.((((((.((..(((((.(((((....((((((..(((...(((..((((.(((((.((.....((((((((((.((...(((...))))))))......)))))))..((((...((((((..((.(((.((((.....))))........))).))...))))))..))))..((((....(((((.......((((.(((......((((((((........(((((((((....(((((..((((...(((.(((((.((((((((((((((..((.............))..)))))))))).........(((((........)))))..(((..............)))................))))..((((((.((((((..((((((((((......((((...(((((...(((((............(((((......)))))...............((...((((((......))))))....))...............))))).)))))))))...)))))))).))....))).))).)))))).......))))))))..............)))).....)))))..))))).))))))))).)))......)))))))......))))))))).)).)))).).))))..)))...))))))))).....)))))...)).)))..))..))))))((((((....)))).)).))))).....))))).)).)))))))))))))))))))..)).)))))))).....)))...))))))..............))))))).......)))))...........)))))))))..)))).))).))))))))))))))..((.((((((........)))))).))....((((......))))..(((((((.(((((........)))))...))))))))))))))))).)))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((,,({.,,..},..}}}}.....{{{{|,,,.))))}...,,,(,,,,||||...,|||,,(((((((({.....)))).)))))|||,},{{{{.....))}.,,,,,......,{,...(((((.....)))))....,,}((((...((,{(((((((..(((({...})))},....,,,,{{,..|({(({,,.,,.,|..))}}))(((.((((((..(((((.....))))).))))))))).....((((.....((..(((....)))..))..,}|}},(((((((((({...(((..((......,.))..)))..))))))))))...,{(((((((({(((,((({.,,......,,,,)),})))........{(((........})}}((((((((((((.{..(((({...})))).,.)))))...{(((((((((({.,...,.....,,......))))))..)))))}.((((....))))..))))))){{(,..((((((.{((((.((((.......)))).)))).,.))))))..))}|{{{..(((((....(({,..(((((....)))))((((({{.....(((((((......{{,,...,,,}}}}.||}..||,{{{.((((.(((((.......))))).)))).,,|||.{{,....,,..}}.....(((.((((((.....((((((((((.(({.........,.......{|{(((((((.......}}},}))).))),|({(((({{{..|.,,.}}))),.,,|}}}))),.,....((((((((((((.....,{{{..(((((........)))))..}|||{({({{{,.{{{...,,,,,,.......,))}}))))}....|{,((..(.((((.....)))).}..)).,,..{(((((....{{.(((,....|||}....(((((..(((((,((((({{......,{|,||}}}}}.....,,,|||........,,,)}....))))).)))))....,,)),,.,.))))}}......|{(((..((.(((((......(((((.((((((.((..(((((.(((((....((((((.,(((,..,{,..{{{|,|||,|.,......((((((((({.{,..,(((...))))}}}}..,,..)))))))......,.,((,,.,{,{{...{.((((.....}}}}.......,.||{{|{{,,|{|,,.,||||,.{(({....(((((.......((((.(((.,....((((((((........(((((((((....(((((.,(({(..,(((.(((((.((((((((((((((..((.............))..)))))))))).........(((((........)))))..(((..............)))................))))..{(((((.{(((((..((((((((((......((((..,(((((,,.((({{..,,.,{.,,{.(((({......)))))..|},.........,,,{{,{(((((......))))))}}.,}}.........,,,..})))}),))}}}))))...)))))))).))....))).))}.)))))},......)))))))).,,,,.........}}}},,...)))))..))))).))))))))).)))....,.)))}}),......)))))}}}}..)}))),.)})}}),,))),..}}))))))).....)))))}}.,,.)))..}),.))))))((((((....)))).)).))))).....))))).)).))))))))))))))))}))..))},))))))).....)))...))))))..............)))))))....}}.)))))...........)))))))}}..||||,||}..}}}}}}}})))))}}{{.((((((........)))))).))....((((......))))..{((((((,(((((........))))).,.))))))))))))))))).))))....,..
Forensic Context

No forensic context available.