Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0005400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0063485 hsa_circEP300_019 hsa-EP300_0086
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41521868-41548354 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41125864-41152350 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-691.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -734.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 639.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..((.....))..)))).((..(((((....)))))....(((....)))(((......((((((((..(((((((.((((...(((....(((.....)))...)))......(((...(((((.....)))))....))).((.(((((((.(((((...(((((...))))).....(((.((...)).))).((((((...(((((((((.((((((..(((((.....))))).))))))))).....((((.....((..(((....)))..))...)))).((((((((((....(((..((........))..)))..))))))))))....(((((.(((.(((((((..........))))))).)))........((((........))))((((((((((((.(..(((((...))))).).)))))...((((((((((((.(...............).))))))..)))))).((((....))))..)))))))))))).((((((..((((.((((.......)))).))))...))))))..((.((((..(((((....((((..(((((....)))))(((((.......(((((((.............(((.....))).....(((.((((.(((((.......))))).))))...))).(((........)))....(((.((((((.....((((((((((.(((.................((((((((((.......))).)))).)))..((((((((((.......)))).....)))))).......((((((((((((.....((((..(((((........)))))..)))).((((((..(((................))).))))))....((.((..(.((((.....)))).)..)).))..((((((....((.((((....))))....(((((..(((((((((..........((((((..........)))))).........))))....))))).)))))......)).....)))))).......((((..((.(((((......(((((.((((((.((..(((((.(((((....((((((..(((...(((..((((.(((((.((.....((((((((((.((...(((...))))))))......)))))))..((((...((((((..((.(((.((((.....))))........))).))...))))))..))))..((((....(((((.......((((.(((......((((((((........(((((((((....(((((..((((...(((.(((((.((((((((((((((..((.............))..)))))))))).........(((((........)))))..(((..............)))................))))..((((((.((((((..((((((((((......((((...(((((...(((((............(((((......)))))...............((...((((((......))))))....))...............))))).)))))))))...)))))))).))....))).))).)))))).......))))))))..............)))).....)))))..))))).))))))))).)))......)))))))......))))))))).)).)))).).))))..)))...))))))))).....)))))...)).)))..))..))))))((((((....)))).)).))))).....))))).)).)))))))))))))))))))..)).)))))))).....)))...))))))..............))))))).......)))))...........)))))))))..))))..))((((((((.((((((..((.((((((........)))))).))....((((......))))..(((((((.(((((........)))))...)))))))......(((((..((...............))..))))).......((.(((..((........))))).)).....))))))..))))))))....)))))).))))))........)))))))))))).)).)))).)))))))...(((...(((.....)))...)))((.((...)).))(((.((((((((.(.(((((........))))).).))))...)))).)))..........((((.(.((((.((......(((((.((...(.(..((....))..))...)).)))))..)).))))).)))).))))))))....))).........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((..((.....))..)))).((..(((((....)))))....,,{..,,|||((({(,.,.{((((((({{.,,,.||||,||||}{{{..,,(({.....))).,,,}}............(((((.....)))))......((({{((((({{,{.|||},||||{....||||,,.....,,.||},.,({(({({........))))))(((.((((((..(((((.....))))).))))))))).....||||.,,,,((|.(({,,..|||,.}}..,},}},(({{(({{|{|...{((..{{......},))..))),.))))))}}))|..((((((((,(.,((...|}..}}}))))))}))}}{|||,.,,..,.,(((,.......,,}}|||{{{,(((((.{..(((({...})))).,.)))))...|||||{{{{(({.{{{{{.,,.{{{{....,)))))).,)))}}},||{,,{{{||||{{|}|||}|(((...((((((.{((((.((((.......)))).)))).,.))))))..))}||||..(((({,,,,(({,..(((((....)))))((((({{.....(((((((......{{,,...,,,}}}}.|,}..||,{{{.((((.(((((.......))))).)))).,,|||.{{,....,,..||.....(((.((((((.....((((((((((.(({.........,.......{|{(((((((.......}}},}))).))),|({(((({{{..|.,,.}}))),.,||}}}))),,,....((((((((((((.....,{{{..(((((........)))))..}|||{({({{{,.{{{...,,,,,,.......,))}}))))}....|{,((..(.((((.....)))).}..)).,,..{(((((....{{.(((,....|||}....(((((..(((((,((((({{......,{|,||}}}}}.....,,,|||........,,,)}....))))).)))))....,,)),,.,.))))}}......|{(((..((.(((((......(((((.((((((.((..(((((.(((((....((((((.,(((,..,{,..{{{|,|||,|.,......((((((((({.{,..,(((...))))}}}}..,,..)))))))......,.,((,,.,{,{{...{.((((.....}}}}.......,.||{{|{{,,|{|,,.,||||,.{(({....(((((.......((((.(((.,....((((((((........(((((((((....(((((.,(({(..,(((.(((((.((((((((((((((..((.............))..)))))))))).........(((((........)))))..(((..............)))................))))..{(((((.{(((((..((((((((((......((((..,(((((,,.((({{..,,.,{.,,{.(((({......)))))..|},.........,,,{{,{(((((......))))))}}.,}}.........,,,..})))}),))}}}))))...)))))))).))....))).))}.)))))},......)))))))).,,,,.........}}}},,...)))))..))))).))))))))).)))....,.)))}}),......)))))}}}}..)}))),.)})}}),,))),..}}))))))).....)))))}}.,,.)))..}),.))))))((((((....)))).)).))))).....))))).)).))))))))))))))))}))..))},))))))).....)))...))))))..............)))))))....,}.)))))...........}}}}}}},}.,))})|||{(((((((({((((((..,(,((((((........}})))).}),...(({{.,,,,,)))}..,|||||({(((((........))))).},,||||||{,{((.((((((((,.....((((({,...{{..{(({{..{....(,,(({..{{.......,)))}),})},,.})).)),..))))))...,,,)))))...))),)))))))))).,....))))))))})).}}})))}},...(((...(((.....)))...))),,.,...,}},||((({({,(((((,(,(((((........))))).}.,}}}|,..|||.}}}........,.,||,.,.{{{{.{{......|||||,||...,.({.{(,,,,}}..}}..,},,)))}),},}.}}))}.})))}))))})))))}}))),........))
Forensic Context

No forensic context available.