Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0012700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0063494 hsa_circEP300_041 hsa-EP300_0101
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41542743-41548016 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41146739-41152012 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-254.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -268.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 190.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((...(((..((((((.((((.(..((((...))))(((((((((..((.............))..)))))))))).)))))))))).)))..)))...))))...........(((.(((((((.....(((((((((((......((((((.((((((..((((((((((......((((...(((((...(((((............(((((......)))))...............((...((((((......))))))....))...............))))).)))))))))...)))))))).))....))).))).))))))...(((((((..((((((((((((((.....((((...))))...))))))).....))))))).....((((.........)))).......(((((((((..((...(((..(((((.(..............(((....(((..((((((((((((((..((........))............)))))))))...........(((((.((...(((((((....).))))))...............)).)))))....................................(((((((...........)))))))((.((((((........)))))).))....((((......))))..(((((((.(((((........)))))...)))))))......(((((..((...............))..)))))..)).)))..)))..)))..............).)))))..)))..)).))))))))).((((...((((....))))))))...))))))))))))).)))))......(((...(((.....)))...)))...........))))).)))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((((((...(((..((((((.((((.{.,((({...})))|((((((((..((.............))..)))))))))).}))))))))).)))..)))...)))).,.,.......,((,(((((((.....(((((((((((......((((((.((((((..((((((((((......((((..,(((((,,.((({{..,,.,{.,,{.(((({......)))))..||,.........,,,{{,{(((((......))))))}}.,}}.........,,,..})))}),))}}}))))...)))))))).))....))).))}.)))))),..(((((((..((((((((((((((.....((((...))))...))))))).....))))))).....((((.........)))).......(((((((((..((...(((..(((((.{..............,,,....,,,..,,{{,(((((((((..{,........}}............)))))))))...........(((((,((...(((((({....).))))))...............,,.)))))....................................(((((((...........))))))){(.((((((........)))))).})....((((......))))..(((((((,(((((........))))).,.)))))))......(((((.,((...............))..)))))..}}.}}}.,))}..||,.......,,,....}.)))))..)))..)).))))))))).{(((...((((....)))))))}...))))))))))))).))))){,....|||...(((.{{..,,,}}.)))...........))))).))})),....,.,
Forensic Context

No forensic context available.