Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0016600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116629 hsa_circEP300_049 hsa-EP300_0044
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41550999-41558783 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41154995-41162779 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-149.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -161.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 166.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......)))))(........((((....)))).........((.......)).(((((((((((......................((((.........(((((.((((....((.((.(((((.(((((((.....((((.((((((((.....(((((.(((.((((((((((.(.((((...(((((...))))).....)))).)))...))))))))...)))..))))).((((((....))))))....((((((((((((....((((((.(((((((((.(((.((((...............))))))).))......).))))))...(((((((((((..((((((((....))))).....)))...)))))))))))..))).))).....))))).))))))).(((((.((((((.((((......))))......)))))).))))).......)))))))).)))).(((.(((.....((((.....))))....))))))....)))))))..)))))))))...))))))))).........)))))))))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......)))))(........((({....|))).....,|,.||,......}},(((((((((((...............,,,...,{(,{,,....,,,,,,(({((,,..}}||},,.(((((.(((((({.....((((.((((((({.{{.,(,,,..,,|},||{{|||,,,{,{{{{,,,{({((.,,}}}||,.,,,||||.},}.,.}}}}))}|,|.}},..}}},},((((((....))))))....((((((((((((....,,{(((,({(((((({.(((.((((,,{.........,..))))))).)}.,,..,)}})))))...{({{{{{{{{|..,{{(((((....)))))...,,|||{{.||||}}}}))),,))))})).....))))).))))))).(((({.((((((.((((......))))......)))))).})))).......)))))))).)))).(((.(({.....((((,....}))}....})))))....})))))}..})))),,,,.,{|||},,}}),,,......,...))))))))))).,)
Forensic Context

No forensic context available.