Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0020200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116636 hsa_circEP300_057 hsa-EP300_0084
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41562603-41569788 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41166599-41173784 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-247.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -267.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 207.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((((.((((...............((((((.((((((.((((((....))))))......((((.(((((((...)))..))))))))))))))....))))))...((((((..(((..(....)..)))....)))))).((((((((...((((((...(((..(((((((.((......)))))))))..(((((((..........(((((..((...((((((((((......)).)))))))).)))))))....((((..((((.((((.....((((.(((((((..(((.(..((((((((((.((((((((((..(((((.((((((((((..............(((((((..((((.((((.......))))))))...))))))).(((((.........))))).))))))...........(((((((.(((((.......)))))....))))))).........))))))))))))))))))).(((...))).((((((((....))))))))..)))).((((((((.((((.......(((..((...((....)).))..)))...........(((((......((((.(((((((....(((((.((....)).)))))...........))).))))..)))).....)))))((..((((((((((((......)))))))))))).))((((((((((...)))..)))))..))..))))..)))))))).....))))))....).)))..))))))).)))).......)))).))))...))))....((((....)))).........................((..........)).))))).))..(((((.(..(........)..).))))))))...)))))))))))))).............)))).)))))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.((((((.(((({{{,....,....,{((((((.{({({,.(((({,....})))))....{((((,{(((({{{...}}}..))))))))))})))....))))))...{{|{||,,|{,,,,,,,,}..))},..,)))))},((((((((...((((((...{{{..(((((((.((......)))))))))..{((((((..,...{{..(((((.,((...((((((((((......)),}))))))).)))})))...}|,,{|{{|,((((((.....((((.(((((((..(((.(..(((((((({{.((((((((({,{((((,|((((((((((..,,..........(((((((,.((((.((((.......))))))))...))))))).(((((......,},))))}.)))))).....,{.,{.((((((,,{((((.......)))))....,}))))),,.,....,))))))))))))))))))).{{|...}}}.((((((({....})))))))..)))}.((((((((.((((..,.{{{(({..((...((....)).))..}))},.........(((((......((((.(((((((....(((((.((....)).)))))...........))).))))..)))).....)))))((..((((((((((((......)))))))))))).))((({{((({(...,,,.,}))))..))..))))..)))))))).....,))))}....}.)))..))))))).)))).....(((....)))..}}))))....((((....)))).........................{{..........}).))))).}}..(((((.(..(........)..).))))),}}...)))))))))))))).,.....,..,,.)))).))))))))}.|.......}
Forensic Context

No forensic context available.