Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0020500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116637 hsa_circEP300_058 hsa-EP300_0050
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41564453-41569788 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41168449-41173784 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-230.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -248.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 181.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.