Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EP300_0081
Host gene
EP300
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
22:41511694-41512788 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41115690-41116784 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-261.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -282.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 282.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((((((.(((........((((((..........)))))).....(((((.(((((((((((((....((((...))))...)))))))(((((((.((..(((((((((......(((((((((((((..........))))))....)))))))...((.(((.(.((((((((((((((((.........((((((......))))))....((((((((.......)))))))).......))))).)))))))).)))).))).))((((.((((....)))).))))..)))))))))....)).))))))).....(((((.((((((((....((((((...))))))...)))))))).)))))((......))...))))))..))))).(((((...((((((((.....(((((((((((......))))))((((........(((((........)))))........)))).....)))))((((((..........)))))).................((((((.........))))))(((((.....))))).))))))))..)))))..........))).))))))))))))((((((................(((((((.......))))))).............((((((((((.....((((((..(((.....(((((................(((.((((((.....((((........))))(((((((((.((.....((....))...))))))))))).(((.((((.((((....)))))))).)))((((.......)))))))))).)))..........(((.(((((.(((........))))))))))))))))........)))))))))....))))))))))((((......)))).............(((....(((((((((((.(..........(((((((....(((((......))))).....)))))))((((((........))))))).))).))))))))....)))((((.....)))).......))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,((({(((({((,(({|{,,....||||((|.....,{..||||||{.,,{(({(({({,((((((((((,,,.((((...||}}...}}}})||(((((((.((..(((((((((......(((((((((((((..........))))))....)))))))...(({(((.(.((((((((((((((((.........((((((......})))))....((((((((.......)))))))).......))))).)))))))).)))}.)})}))||{{.{{{,....}}}}.,,,,..)))))))))....)).)))))))},...(((((.((((((((....((((({...})))))...)))))))).)))))((......))..........{||||,.,,|||}}.((((((((.,,((.{(({((((((......))))))}))))...,,,{{{,....,}}}||,||.....,,,,...........}}}}{{{{{{.,,,,,,...}}}))),,...............((((((.........))))))(((((.....))))).))))))))..}}}}|||||,,,,}}))).}|||||}}},}}||||||,.,...,,..,.....(((((((.......))))))).,,.,,...,,..((((((((((.....((((({.,(((,,...(({{,........,,{.,.,,{({.(((({{.....((((........))))(((((((((.((.....{{....}}...))))))))))).{({|{{({|({{,..,,}},,}}}},}}|(({{.,....})))))})))}.)}}.........{(((.(((({,(((......,.))})))))))))}}}}........)))))))))....))))))))))((((......)))}..,.........{(((....(((((((({{{.,.,,.,,...,{(((({{,{..(((((......)))))....,))))))}|(((((........)))))},.}}},))))))))....))))|||.,,}})),}}}}}|||}}}.)))
Forensic Context

No forensic context available.