Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0002800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EP300_0012
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41513191-41527637 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41117187-41131633 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-175.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -188.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 115.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((...(((....((((((..((((((((.(((......)))...((((.(((.(((((((((((((((((.(.((((....))))(((((((.(((((((((((...)))))))....(((((..((((((((.....((((....))))..))))).)))..)).)))...((((((........))))))......((.(((.(((((.(((((((((((((((.....))))))))....((((...))))(((.(((.(((((.((.(((((...))))))).)))).).)))...))).))))))).))))).))).))......((((.((((.......)))).))))....)))).))))))).))))))))..))))...)))))).))).))))))))))))..(((((((........((((......)))).)))))))......))))))..)))))))))((((..((((.(((..(((........)))........((((.((....(((((((((......................))).))))))..((((.....)))).))))))))).))))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((,,,{{{....((((((..((((((((.(((......)))..,((((.(((.(((((((((((((((((.{.((({....))))(((((((....{(((((((...))))))}}}..(((,,..((((((((.....((((....))))..)))))},))..,}.}}}...((((((........))))))....,.|..(((,(((((.(((((((((((((((.....))))))))|{,,{{{|,,,||||{{({(((.{{{{{.{{.{{{{,...,)))))).}))),).,}}.......))))))).)))))})),.{(((((.,((((.((((.......)))).)))).,.)))))}))))))).,)))))))..))))...)))))).))).)))))))))))),,(((((((...........|,.,,,))).|,|}}}})),,....))))))}})).))))))((((..((((.(((.,{,,........}},......,{((((.{,....(((((((((......................))}|))))))..||{{.....}))).)})))}))).))))..)))).
Forensic Context

No forensic context available.