Basic Information

Symbol
hsa_chr22_0178700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EP300_0122
Host gene
EP300
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
22:41516067-41516945 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41120063-41120941 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-240.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -259.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 211.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...........(((.((.(((((((((((((((((.((((..((((((((((((....(((((((((......))))).(((((....)))))....(((((((.(((((((((...(((...((.(((..(((....(((((.....((((((.(((.((((....((((((((.(((((((((((((.....)))))))(((((..((.((((........)).)).))..)))))(((((....)))))))))..)).))))))))...)))).)))..((((((..(((.(((((........)))))..)))..))))))..))))))...)))))...))).)))...)).))).))))))..))).)))))))....((((((....((((........)))).))))))..))))..(((((...(((..(((........)))..))).....)).)))...(((((...............((((((((((((..........((((..((((.......))))))))......))))))))))))...((((((........)))))).(((((.....))))).....)))))...))))))))))))...))))..)))))))))))))))))))..)))...(((((((...)))))))......((((((((((..(((((((((((.......((((...(((((...........(((..((.....((((.........)))).......))..))).......((((((..(((...)))...))))))...))))))))))))))))............))))...))))))))))...)))(((((....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..,{{{,....(((.{(.((((((((((((((((((((((..((((((((((((..,(((,{(((((......))))}.{||||.,,,|}},}.,}}(((((((.(((((((((.,(((...((((({(....}}.})))).,..)))|(((((.(((.((((....((((((((.(((((((((((((.....)))))))(((((..((.{{((........)).)}.))..)))))(((((....))))))))),.,).))))))))...)))).)))..((((((..(((.(((((........)))))..)))..))))))..)))))|(((({{(...|{....}}.)))},))),))))))..))).))))))),,,,{(((({....((((..,.....))}}.})))}},|{((..,{.,||,.{{{{|,,,,..,,...,}},..||||,.(((((.((((((((((((..(((.........)))..)))))}.))))))...))))}.||||....,{{|||,{|{|{{.......,,.},)))),,}||}))},..}}},.}})}}|,(((((.....))))).}.,..)}},...))))))))))))...)))))})))))))))))))))))))..)))..,{((((({...})))))|,.....|(((((((((.{(((((((((((,,.,,,.{{{{...{{{{{..,.,,..........,|||,.......,.,,.,.,},,,...........{{{.....,.({{{{{..{{,...}))...}}}}}}...))))))))}}}}))))............)))).}.))))))))))}},)))(((((....)))))
Forensic Context

No forensic context available.