Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0008100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EP300_0166
Host gene
EP300
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:41525894-41533794 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41129890-41137790 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-160.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -171.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 117.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((.((((.(((.(.((((.((.(((((...))))))).))))(((.((((....)))).)))(((.((((...((((((..((((.((((.......)))).))))...))))))..))))))).((((((.((.((....)).))...((((((((((((....(((((((........((((......)))).)))))))..)))).)))).))))((((((.......))))))((((((..(..(((.((...(((...((((.((....(((((((((......................))).))))))..((((.....)))).))))))...)))...)).)))..).))))))..(((((((..((((.(((((..(....)..)))))(((((........)))))..............))))..)))))))....))))))....).))).))))))))))))).....(((......(((.....)))......)))....((((((...........))))))..(((((((..........))))))).....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((.((((.(((,{.((((.((.(((({...})))))).))))(((.((((....)))).)))(((.((((...((((((.{((((.((((.......)))).)))).,.))))))..))))))).((((((.{{.((....|}.||.,,((((((((((((,,,.(((((((.........,.,.....})),).))))))),.)))},)))).)))}((((((.......))))))((((((..,..(((.((...(((...((((.{,....(((((((((......................))},))))))..((((.....)))).))))))...)))...)).)))..).))))))..{{|||||..{|||.(((((,,{..,.)..))}))(((((........)))))..,{,,||,,...,)}))..})))})}....))))))..}}).))}.))))))))))))).....(((,{....(((.....))),,....,,,{(({....|))}....|,.,,||||||..(((((((.,,.....,.)))))))...,,,...}|}}..}.....
Forensic Context

No forensic context available.