Basic Information

Symbol
hsa_ERBB2IP_0012900
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0129392 hsa_circERBB2IP_019 hsa-ERBIN_0034
Host gene
ERBB2IP
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:65307877-65322245 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:66012049-66026417 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-197.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -212.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 135.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........(((((((.((.......((((((....)))))).....)).)))))))..(((((.((((.((((((......((....))..((((.((((((...(((........)))(((((.....)))))((((((((((((((((((((......))))))......................)))))))).)))))).(((((....(((((......))).)).....)))))...))))))))))...((((((((........)))))))).(((((((.((.((((((((...(((((....)).)))...)))).(((((((((((((((((((((..............))))))))))))....((((((((.((...((((.((((((.........)))))).))))((((...(((((..(((((.....))))).)))))..))))..........................((((((((.....((.((((..(((((..........))))).....((((((((((..((((((..(.((.(((...((((((.....)))))).....))))).)..)))))).....(((((((((...))))))))).....))))))))))(((((.((((......)))).......(((((((..............))))))))))))))))))...))))))))............)).)))))))))))).)))))...)))).)).)))))))...))))))))))..)))))...........((((((......)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{{(,.,.(((((((.({.......((((((....)))))).....)).))))))),.{||||.{{((,((((((....{{({....)).,((((.((((((...,,,........}},(((((.....)))))((((((((((((((((((({......})))))......................))))))))}))))),.(((((....{{(((......))).}}.....)))))...)))))))))),..{(((((((........)))))))}.(((((((.((.((((((((,..{,,{|,,,,||,}||...|}}|,(((((((({{(((((((((((..,,..........)))))))))))}....((((((((.((.,,{((((((....})}}},...,,,,.|{{|.{({((,..(((((..(((((.....))))).)))))..}}}}...,.,,.},,}.,,.,,,..,,,..((((((((.,,..((.{(((..(((((..........))))).....((((((((((..((((((..(.((.(((...((((((.....)))))).....))))).)..))))))...,.(((((((((...)))))))))..,..))))))))))(((((,((({......}})).......(((((((............,.)))))))))))))))})).},)))))))),,.....,,...)).))))))))}))),,))))...)))).)).)))))))...)))))))))}..},,,}...........((((((......)))))).....
Forensic Context

No forensic context available.