Basic Information
Symbol
hsa_EP300_0017300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EP300_0217
Host gene
EP300
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
22:41551516-41560444
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41155512-41164440
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-862.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-909.10 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
533.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....)))(..((((((((....((...((((........))))...))((((((((((((.......((((((.....))))))......................((((.(.(((((((.((((((((..((((...((((((...(((((..(((...))).)))))...))))))......((((((((......))))))))...(((((((...((((((((.((((...))))..)))))).........(((((((.(........).)))))))))...))))))).....(((((((((.....((((((............(((((..((((..(....)..))))))))).(((((((((..((.(((((............))))).))...)))))))))..............(((((.(((....))).)))))))))))...)))))))))..((((((.(((((...((.((((.............((..((((((((((((((((((..((.(((((((((((((.(((((((.(((.(((((((..(((((...(((((((..((((((((((((((((.((((.(((...((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.((.(((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((.(((((((((((.((((((....(((((.(((((..((..(((.(((((((.(((.((....((((((((((((.((((((((..(((((((((((..(((((((...)))))))))))..((((((.....((((((((((.((((((((....))))))))...))))...((((....))))(((((...)))))..))))))...))))))...)))))))..)))))))).))))))))))))....)).))).))))))).)))..))..))))).)))))....)))))).))))))))))).)))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))..)).))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).))).)))).)))))))....)))))))))..)))))))...)))))..))))))).))).))))))).)))))))))))))....))..)))))))))))))))))).))((((((...((((((((((((((..((((((((((((..(((...(((.......)))...))).))))......)))))))).))))))..........)))....)))))...)))))).......((((((((.(((((..((((......(((((.((((((.........((((((...))))))((((.(((((...))))))))))))))).))).))....((((((.....((((..((((((((((.........)))))))............(((((........))))))))..)))).....))))))(((((..............((((((((....(((((((((.((((((.(((((..((((.(.........).))))...))))).)))))).))))).)))).)))))))).....(((((((((((........(((.(..(((..((.((.......)).))..)))..)))))))))))))))....))))))))).))))).))))))))((((((.....)))).))((((((....))))))..)))).)).))))).))))))...(((....((((.(((.((((...............))))))).)).))..))).))))....)))))))).))))))).)))))......(((((...)))))((((....))))...))))))))))))..(((((((.((.((((.((((((.((((......))))......)))))).)))))).)).)))))..(((((((((.....)))))))))((((.......)))).......((((((((((.((((((((.....(((((.((((((.((((((((((.(((((.(((..(((.(.((...(((((...))))).....)).).))))))))))))))).........((((((.((((((....))))))..))))))..))))))..)))))))))))...))))))))...(((((..((.....))..))))).(((((......)))))............((((((((.((((((..((...((.(((..(((....)))...))).))...))..)))))).))..))))))...((((..((((((((((....))).))))))))))).......(((((...(((((.....)))))...))))).................)))))))))).((((.........))))........))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.....)))(..((((((((,,,.,,.({((({..,,,,..}}}}.,.||({((({{((({{.......{(((((.....)))))}..................,{,.,,,,,|,|{{{{||,||{{{{{{.........((((((...(((((..(({...})).)))))...))))))......((((((((......))))))))...{{{{{{{...,.((((((.((((...})))..)))))}.{,.,,{{{(((({{{.{,{{,....)})))}},,||{{{,|||,|}{{{..{((((((((.....((((((,...........,,{,,..||,|,,,.{{{{{{,{{{{{{||,{{(((((((,.((.(((((..,{......},))))).)).,.)))))))))}}}}}}.}}})}}.{((((.(((....))).)))))))))))...)))))))))})),.||||||||,.,,{(,{{{{{{,,,,,{,....{(,.{(((((((((((((((((..,(.(((((((((((((.(((((((.(((.(((((((..(((((...(((((((..((((((((((((((((.((((.(((..,((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.{,.(((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((.(((((((((((.{(((((..,.(((((.(((((..((..(((.(((((((,((({((....((((((((((((.((((((((..((((((((,,...(((((((...))))))),|||..{(((((.....,{{{{{{,((,{(((((((....))))))))}}.}},,...{{{{.,.,)))){{({{...}}})).,)))}}}...))))}}..})))))))..)))))))).))))))))))))....)).)))}))))))).)))..))..))))).))))).,..)))))}.))))))))))).)))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))..}}.))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).))).)))).))))))}...,))}))))))..)))))))...)))))..))))))).))).))))))).))))))))))))).,..),..))))))))))))))))}}.,,((((((...(((((,,,((((((..((((((((((((..({{.{.(((.......)))..,))).))))......)))))))).)))))).,........,,}.,..)))))...)))))).......,(((((((.(((((..(((((..{{.{{(((.((((((.........((((((...))))))((({{(((((...})))))))})))))).))}.||,|,{((((((,{..,((({..{{{(((((({.,,....,,))))))}..,|||.{{{{.(((((......,.))))).))}})))),..,,}))}})||{||,..,.......,,,{((((({{....(((((((((.((((((.(((((.,((((.{.......,.).))))...))))).)))))}.))))).)))).)))))))).,,.,{{{((((((((........(((.(..(((..((.((.......)).))..)))..)))))))))))))||,,.,))))))))).))))).)))))))|((((((.....)))).))|(((((....))))))..,,||,{|||||||,}}},,,||||,{,{{{((((.(((.((((.,{.........}..))))))).)).}}..}))}))))).,,}})))})),))}}}||{((((....))))},,,..|}}||,{(((....)))},}}))))))}}}})),,|{|||||,|.(((({.((((((.((((......))))......)))))).})))),.}},,))))..(((((((((.....)))))))))((({.....,.))))...,,..((((((((((.((((((((.{(..(((({,((((((.,,{((((({{.((((,{(((..{(({{.{{...(((((...)))))...,}.}}}}},,)))))))))))),.....,..{(((((.{{{(((....})))))..)))))}..}},}}},.))))))))))).,,)))))))).,,(((((..{,.....,,..))))).{{(({...,,.}}}}}........,{{{({{(({,,.,{{{{{..|{...|||||({,..,,}}.))),,,.,},)),,.||,,}}}}},.,..,)))})}...((({..((((((((((....)))},)))))))))).....,,,{(((...(((((.....)))))...)))))},,},,,..........)))))))))).,,||,,,..,,,,)))),,,.,,,.))))))))..)
Forensic Context
No forensic context available.