Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0018500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EP300_0116
Host gene
EP300
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
22:41554519-41556038 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41158515-41160034 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-416.68 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -446.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 340.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((...)))).)))))))).(((.(((((.(((((((.((((((((..((.......))..)))))))).))))).((((((((((((.(((((...((((((((((.((.....(((((((((........))))))................(((.(((((.........))))))))(((((.......))))).(((((((..((((((((...))))))))(((((....(((.......))))))))..)))))))......(((((((.........)).)))))..(((((((((...((((((((((.........................(((((((.(((((..(((...((((.......))))..)))..))))).)))))))..((((((...((....))..)))))))))))))))))))))))))...(((((((((..(((((..........((((....)))).................((((((((((.(((.........(((((.(((((((((((((.(((((....)))))...........(((((((...((((((..(((((..(((.(.....................................).)))..)))))))))))(((((...))))).))))))))))))))..)))))).))).))...))))))))))))).............))))))))))))))..(((((((......))))))))))....)).))))))))))((((((((.((((.((((((((((((((((.......))))))).............))))))))).)))).)))..((((((.(((((.((((((((((((...((.(((((((((..........)))))))))((((..((((.......))))..)))))).)))).)))))..))).)))))..)))))).)))))(((((((((........))))))))).....))))).))))...((((........))))...(((...........))).((((((((...((((((.....))))))((((....))))((((....))))...........))))))))....((((((((.((........))...))))))))((((((((...))))))))((((((((.(((((((((((((.........)).)))))))..))))))))...)))))))))))).............)))))))........((((((...(((.((.((((.(((((...((((...(((.((((...)))).)))..))))....))))).)))))).)))))))))((((..(((....)))..))))((((((...(((((.(((...(((((((......(((....)))......))))))).)))......(((((.(((((.....)))))...)))))....)))))...))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((...)))).)))))))).,((.(((((.(((((((.((((((((..((.......))..)))))))).))))|{{,{{{{{{|||{,,(((((..((((((((((.((.....((({(((((........)))))}.....,.......,..{({,({(((..{{....,|||,|,((((.....)))},|||},.(((((((..((((((((...))))))))(((({...{(((.......))))))))..)))))))..,,,.(((((((,,....,,.))}}))))..(((((((((...((((((((((,.............,..........(((((((.(((((..(((...((((.......))))..)))..))))).)))))))..{{{{{{...{{....}),.}))))))))))))))))))))))))...{{({{{{{{..,,{((....,,,..,|,,|,,,,}})}.................((((((((((,({{,.{{,,,..{,{{{.(((((((((((((.(((((....)))))...........(((((((...{(((((..{((((..{{{........,.......................},.....}.}},..))))))))))}{{{({...))))).))))))))))))))..)))))).)}).},...,,.)))))))))).,,.....,,...,.,},}}}}}}}}}.,{((((((......))))))))))....)).))))))))))..))))).,|{{|,{{{((((({(((((((.......))))))}.........,,{{|}}||||||.}||}.}}},,|,.||||}|||{,|,,{{{,,,,...,,}}{(((((((((..........)))))))))}.,,.{(((,{{{{{{(((({{{|,..,,,|||,,,{{|..||},{(({{....))))),|,.,,|{(((((((........))))))))|||,..,,}}}}}},....((((........))))...,}}}}}}}}..}})))).((((((((...((((((.....)))))),{{{...,}}}}{{{(.,,.}||}.....},}},.))))))))....((((((((.((........))...))))))))((((((({...))))))))..|}||||.{((((((((((({,,.......)),)))))))..}))))))))))})),,,....,...((((((((((((((({(((,....,)))}|...(((((((({({...(((((((,{{,....,,{{{,,,...,,,}|||||,,}|||||(((((.{(((..(((((((....((((..(((....)))..))))......,,)))))).)))}.))))).}}},...))))))).),,}.))))))))(((((((((......)))))))))....,{,||,,.,,.)),},}.))))}..}))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.