Basic Information

Symbol
hsa_EP300_0019800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EP300_0139
Host gene
EP300
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
22:41560057-41563388 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:41164053-41167384 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-238.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -252.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((.((((.((((((((((((.........)))))....)))))).).)))).))(((((((((((((((.((((((............(((((.....(((((((((((.(((((.((..((((((....))))))(((((((...(.(((((....))))).)...)))))))....((((((((.....))))))))........(((((((...)))))))...............((((((((((((((((((((....(((((((((((.....(((..(((......(((((((((.(((......))).)))))))))...........((((((((.......(((.((((.......))))..)))))))))))........(((.....))))))..)))..))))))(((((((.((.(((...(((.(((.......))))))))))).)))))))....)))))...))))))))))))).(((...)))))))))).....((((.......(((((((((.........)).)))))))......)))).)).))))).))).))))))))....))))))))))).((((((((.....((((....)))).....)))))))).................((.(((((.....))))).))))))))).))))))))..((((((..((((((((((((....((.((((....)))).))....))))))).((((((......))))))..................((.((((((((((((.....))))).))))))).)).......))))).))))))((((..........))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((.((((.((((((((((((.........)))))....)))))).).)))).)}(((((((((((((((.((((((..,,.,...|}.(((((.....(((((((({((.(((((.((..{(((({....}))))|(((((((...{.(((((....))))).}...))))))),...((((((((.....))))))))........,,,{{{{..,|||||||{{.,,...,..,,.,|||||||||((({{{{{{{{,...{{{,,((((((,{{{.,{{.,|||,.....(((((((((.(((......))).))))))))).,,,,,.....((((((((,.....,(((.((((.......)))),}))))}))))))..,,,,,|(((.....))))}}..}}}..})))))(((((((.((.(({...((,{(((.......))))))))})).)))))))....}}}}}...))))))))))},},|(({{{...))))),......{(((.{.....(((((((((.........)).)))))))....,.)))),)}.))))).))).))))))))....))))))))))),((((((((.....((((....)))).....))))))))..,,,,,........,,||,(((((,...,))))).},))))))).))))))))..((((((..((((((((((((....((.((((....)))).))....))))))).((((((......))))))..........}}......((.((((((((((((.....)))))},)))))).)).......))))).)))))){(({..........}}})..
Forensic Context

No forensic context available.