Basic Information
Symbol
hsa_EPB41_0016500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0011173
hsa_circEPB41_018
hsa-EPB41_0072
Host gene
EPB41
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:29362338-29379824
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:29035826-29053312
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-131.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-139.58 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
103.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....)(.((((....))))....(((........)))......((.(((.((.((((((((((((...((((((..(((...(((..(........)..)))..))))))))).))))...........))))))))))))).)).((((..((((....(..(((((((.((...((((((....((((.(((..(((((((.((((..(((((((((...((((...((.....))))))....)))).....)).))))))))))))))..))))))).....((((((((((.....))))....((((((((((((((.........)).)))).))))))))..((((((...)))))))))))).......((.((...(((..........)))...)).))..((((...................))))..)))))).))))).))))..)......))))..)))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(....}(.((((....))))....(((........)))......((.(((.((.((((((((((((...(((((({,(((...(({..{........)..)))..))))))))).))))...........))))))))))))).)).((((..{(((....,..(((((((.((...((((((....(((,{(((..((((((,{((({.,(((((((((...((((...((.....))))))....)))),....)).))))))))))))))..))))))){,{({((,,,.||||,.,|.||||{{,.((((((((((((((.........)).)))),,))))))),.||{(({...)}}|||.|||,|.......||}{|}|.{{{....,.....,}}...||,|,..||||}..,|......,,....,.,)))..)))))).))))).))))..}......))))..)))).)
Forensic Context
No forensic context available.