Basic Information

Symbol
hsa_ERBB2IP_0016600
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0129398 hsa_circERBB2IP_027 hsa-ERBIN_0069
Host gene
ERBB2IP
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:65320134-65340138 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:66024306-66044310 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-210.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -227.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 230.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((......((((((((.((...((((.((((((.........)))))).))))((((...(((((..(((((.....))))).)))))..))))..........................((((((((.....((.((((..(((((..........))))).....((((((((((..((((((..(.((.(((...((((((.....)))))).....))))).)..)))))).....(((((((((...))))))))).....))))))))))(((((.((((......)))).......(((((((..............))))))))))))))))))...))))))))............)).))))))))......))))))))(((.(.((.(((((.(((.....((((((........((((....((((((......))))))....)))).......))))))..((((((....)))))).(((........)))...(((((((((..(((((........((((((...(((((.......(((.....))).(((..(((.....)))..)))...........(((((((((.(((..((((..(((((...((((..((......))..))))...)))))..))))..))))))).))))))))))...))).)))((.(((((.((((((..(((.......))).........(((((....))))).(((..(((.((((....)))).)))..).)).....))))))))))).))..((((..(((..............)))..))))))))).....)).)))).))).......))).)))))..........((((((.........................)))))))).).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{((((,{{,..(((((({{.({.,.,{((|((,|||)),,,....,,,,.,,|,.,((((...(((((..(((((.....))))).)))))..))))...,}}}}}})).,..|||{,{{{,,{{{(((((,(({.((,(((({,(((((..........))))).....{(((((((((..((((((..(.((.(((...((((((.....)))))).....))))).)..))))))...,.(((((((((...)))))))))..,..})))))))))((((({(({,......}}}}.......(((((((............,.)))))))}))))||}}}}.||))))))))|,..,,,,....}}.}})))))},,,|||)))))}||(((,(,{{.{((((.{{|,,,..((((((..,.....((((....((((((......))))))....)))).......))))))..((((({....}))))).{{{...,,,.,|||...{||||,|||,,{,,{{.||,....((((((.,.((((({{.....||,.,{{..,}.{{{..{||.....|||,.}},.,,.......{((((((((,,(((..((((..(((((...((((,,((.....,)),.))))...)))))..))))..))))))).))))))))))...))).)))||}|||||.((((({..{{{,......}}}.........(((((....))))).{({..(((.((((....)))).)))..}.}).,...)}}}))}))}}.}}..{{{{,||{....{{,.,,.....}})..}},,,,}},.....))}})})})))}}...,.))),)))))....,,,,,.((((((....,,,.....,,,..........))))))}},),)))
Forensic Context

No forensic context available.