Basic Information

Symbol
hsa_EPHB4_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0081529 hsa_circEPHB4_002
Host gene
EPHB4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:100410717-100421895 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:100813095-100824273 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-783.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -810.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 479.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((.(((((...........((..((((((((.(((((.(((((((((((((((((((((((((.((((((.((((((((...(((.(((((..((((...((((((((((((....)).)))).(((((.(..(((((((..(((.(((((((((((...)).)))..)))).))...))))))))))..).)))))))))))...))))..))))))))))))).))).))).))))))))...(((((((((((((....(((((((.......))))))).....).))))(((((...(.((((((((((......))).((((.((((.((.....)).)))).)))).......))))))).)..))))).......((((.((((((((..(((((((((((((((..(((..(((((((((...)))))((..(((.(((((..(((..((((...((((((((...))).)))))((((..(.(((((...))))).)..))))............))))..)))..))))).)).)..))))))))).)))))))....)).))))))(((((((((((((((((((((((((.....((.((.((((...))))))((((((((((((.((..(((......)))..))..))..)))))).))))))....))))))))))))).))))))).))))).((((((..((((..((..(....)..))..))))))))))...))))))))..))))......(((.(((((......))))).)))....))))))))....((...(((((.....)))))...))))))))))(((((((.(((((((((((((((((.(((.(((((.((.((((.((((((...(((((..((((..((....)).)))).))))).....(((.....)))(((...........)))..)).)))).)))).)).)))))))))))...((((((.((((((((.(..(((.((((.(.(((((((.(((((((((.(((((((.((((((((((..((........))..))))((((((((((((((..(((.((((((((((((((((.(((((.(((.(((((((((((..........))))))))...........)))))))))))...))))))((((((((((........(((((...((((((.(((((...(((......)))...)))))..)))))).))))))))).)))))))))))..((((...(((((.((.((((.(((((...))))))))))).)))))..))))((((....)))).............))))).))).))))))).(((((((.(((((.((((.....))))..))))).))...))))))))))))...)))))).(((((....)))))....))))))).)).))))).)).))))....((((....)))).......((.((.((((......)))).)).))...(((((((((.......))))))))).))).).)))))))..).)))))))).)))))).((((.((((.((..(((..((.((...((((((........))))))...)).)).....))))).)))).)))).....)))).))))))).....))).)))))))..((((......)))).(((((....)))))..(((....)))...))))))).................))))).))))).)).)))))).))..))).)).).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....(((({.,,({(....,,....,((.{{(((((((.(((((.(((((((((((((((((((((((((.((,(((.{(((((((,,,(((.(((((..((((.,.(((((((((({{....}),)}}}{(((((.,({((((((({,(({.((((({((({|...}}.)))..})))|)|,..,,))))))))}}},))))))))))).,,)))).,))))))))))))),})),))).))}))}}}..,({(((((((((({.,..(((((((.......))))))).....|,}}}}(((((...(.((((((({({......}||.{(((.((((.{(.....)}.)))).))))}}...,.))))))).)..))))).,....,|{{|.{{((((((,{{{{{||(((({{{{{,,|{{..(({,{{{{{,..)))))|||.|||||||((..(((,{(({,...((((({{,.,,))).}}}|{((((..{,{((((..,}}}}},|..||||,...........,}))},}}},,}|||,,,}||..||}}}}}|}.}}}})))....}}.}})))}((((({(((((((((((((((((((....{.((((.((((...)))))))),,,((((((,.{{.{{{.((((.{{....)))))).,)),..}.)))))}....))))))))))))).))))))}.))))).|||{||,.|{{{,{(|.{(,.....}),,})))))})))},,})))}}))).,}}}}......(((.(((((......))))).))),,..))))))))....{{...(((({.....}))))...})))))))))(((((((.(((((((((((((((((.(((.(((((.((.((((.((((((...(((((..((((..((....}).)))).))))).....(((.....))){{{,,{........))}..)).)))).)))).)).)))))))))))...((((((.((((((((.,{,(((,(((({({{{{{{{{.{{|||((((,((({(((.{{{{|||{||,,|{,,,.....}}..}}}|((((((((((((((..(((.((((((((((((((((.(((((.(((.(((((((((((..........))))))))...........))}))))))))...))))))((((((((((........(((((...((((((.(((((.,.({(,,....)))..,)))))..)))))).))))))))).)))))))))))..((((...(((((.({{((((.(((((...))))))))))).)))))..)))){{((....|||}....,,,......})))).))).))))))).(((((((.(((((.((((.....))))..))))).))...)))))))))))),..)))))).{(({{.,,,|||},.}}})))))))})},||||}.||{|||}..,.||||...,)))).,.....{{.{{.((((......)))).)),}),},{{{{|{{|{..,....))))))))},|||,|.}}}})})}}),)))))))).)))))).((((.((((.{{.,(((..((.((...((((((........))))))...)).)).....))))}.)))).)))).....)))).))))))).....))).)))))))..((((......)))).(((((....})))).,(({...,}))...))))))),,,,.......,,....})))).))))).)),}))))..}).}))).)).),))))
Forensic Context

No forensic context available.