Basic Information

Symbol
hsa_SLC12A9_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EPHB4_0012
Host gene
EPHB4
Type of circRNA
Intergenic-Intron
Location (GRCh37)
7:100417409-100425050 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:100819787-100827428 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-733.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -757.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 398.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.