Basic Information

Symbol
hsa_SLC12A9_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EPHB4_0026
Host gene
EPHB4
Type of circRNA
Intergenic-Intron
Location (GRCh37)
7:100420128-100424866 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:100822506-100827244 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-375.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -389.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 212.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((.((.(((((((((.(((..(((((((......)))))))..((((...((((((((((((((((..(((((...))))).)))...((((.....))))(((((((.(...(((((((((.(((((((((((.((((((((..((((.((((((.((((.((.....)).)))).))).)))))))..))))))))..)))))....)))))).....((((.((((.......)))).).))).))))))))).).))))))).((((..((.(((.((((.(((((((((((((((((.(((((..(((((((((((((((((..(((.((((..(((.((...)))))))))))))))..))))).....)).)))).))).((....)))))))))))))))))).....))).)))....))))))).))))))(((((..(((....(((((............))))))))..)))))...........)))))))))))))..))))....((((.(((.......)))))))...((.((.(((((.(((((..(((((((((.(.((((((.(((.((.((.(((.....(((((((....)))))))))).)).)).))).)))))).)))))).))))........(((((......(((((..((((((.......))))))..))))))))))))))).)))))..)).)))))..))))))))).)))))).)).)))((.(.(((((.....)))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({(,(({,.((.((((({({(.(({..{{{{{{(||,...)))))))..((((...(((((((((((({(((..(((((...))))).}}}...((((.....))))(((((((.,...((((((((({((({(((((((.((((((((..((((.((((((.((((.((,...,)).)))).))).)))))))..))))))))..))}}},.{{||||||{,...,,{|.||||}}}}..,))))}))))}.))))))))).).))))))).((({.,((.(((.((((.((((((((((((((((,{((((({(((({((((((((((({{..(((.((((..(((.((...))))))))))))))}.,))))).,..,}),)))}.}}}........,)))))))))))))))).....))).)}}....))))))).)))))){((((..{{{...|{{|((|........,,.,,}}})))..)))))...........}))))))))))))..))))....((((.(((.......))))))).((((..(....|..)))}..{(((((((((.{.((((((.{({.((.({.(((.....(((((((....)))))))))).}).)).})).)))))).)))))).)))),...{{((({((({{....|||||}}||||||},.||.{||||||.{||,,|||||||}|||,|}|||||}|||}||||.}}}))))}),))))))}))))})||}|,|{{||,..,,))))),.))
Forensic Context

No forensic context available.