Basic Information

Symbol
hsa_EPHB4_0000300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EPHB4_0018
Host gene
EPHB4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:100402788-100420289 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:100805166-100822667 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1025.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1066.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 613.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

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