Basic Information

Symbol
hsa_chr7_0009600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EPHB4_0017
Host gene
EPHB4
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
7:100403818-100412428 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:100806196-100814806 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-695.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -726.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 337.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.......)))((.((((((.(...((((((((((((((((((.(.(((....)))).)).))))))...........(((((.((((..........)))).)))))......((((((((((..((..(.((((.(..((((((((((...................))))))).)))..).)))))..))....))))...))))))((((((......)))))).........))))))))))(((((.((((..............((((((..(((..((((......((((......))))((((((....))))))..((((....))))((((((....)).)))).(((((........)))))))))....)))...))))))..(((.((....)).))).......)))).)))))...(.((((.(((((((.(((..(((((((..((((......))))..)))))))..)))((((((((((((.((((((..((((.(((((.(((((((...))).))))((.(((((((((((.((.((((((((((.(........).))))))))))))..((((((.(((...))).)).)))).(((((.(((...)))..)))))..))))))))))).))......((((.....)))).........(((((((((((...(((((......(((...((.....))..))).....(((((((...)).))))).......(((((....((..((......))..))......))))))))))))))).)))))).(((.......))).......(((((..(((..............)))..)))))..((((((((((((((........((((............))))...........))))))))))))))........))))).)))).)))))).))).))))).......)))).....(((((((((((((....((((((((....)))))))).................(((((.....(((((((......(((.....)))((((.......))))((((.(((....((..((...((.....))))..))...))).))))(((((......))))))))))))..((.(((....))))).(((...)))......((((..((....))..))))((((((......)))))).))))).)))))))).....)))))))))))).(((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((....)))))))((((......)))).....))).)))))))).)))))))....(((((.....)))))....)))))))))))))((((((...)))))).)))).)((((((((.(((((((((((((.........)).)))))))..))))))))...))))...((((((((((((((((((.(((..((((.((((((((((((((((((..((((..((((((((((((((((...((((((...(((((((((........((((((.(((.((((.((......)).)))).).)).))))))))).((((((((((....(((((((.(((....))).)))).)))....))))...))))))........(((((...((((((.(((((.(((.....((((.........))))...))))))))))))))...))).))............((((((..............))))))....))))))..))))))...))))...)))))))..)))))))))..)))))))))))))))))))))).)))...))))))))))))))))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.......)))({{((((((.,...(((((((((({(((((((.(.(((....)))).))}}})))}.,........,{||||}||{({.........,}},,}|}||||....((((((({{{..,({.{.((((.|..{(((((((({...................})))))).)))..}.))))},.))....)))),..}))))}((((((......)))))).........))))))))))(((((.((((.....,...,,.,,((((((..(((..((((......((((......)))){{({{(....}}}|||,.,(((....))))|||||{...,}).}}}}|{((((........))))}))))....)))...))))))..||,.||,,|,||,,,,.))}...)))).)))))...{.((((,(({((((((((..(((((((..{(((......))))..)))))))..)))){{{{(((((((.((((((..((((.(((((.(((((((.,.||||,}||{(.(((((((((((.((.((((((((((.(.,,....,).))))))))))))..(((,((.(((...))).)).)))).(((((.(((...)))..)))))..))))))))))).||,|....((((.....)))).........(((((((((((...(((((..({.(((((,...,{,..|...,,|.,|..(({{{{|,..)),)}))).{{{{....)}}}...{{..{{......))..})}.}}.,},,,,))))))))))},))))).(((.......))).....,.{((((..{{{........,.....,))..)}))).}((((((((((((((,,......((((............))))..,,.......))))))))))))))........))))).)))).)))))).))).)))))||||,,.}}},.....(((((((((((((....((((((({....}))))))).................(((((,{{{,(((({{{....,,{((.....))}((((.......))))((((.{{{,,,{{{{{(,.,.|||....))))..))...))),)})){((((......)))))))))))|,.{(,(((,...}}}}},|||,,.,))......((((..((....))..))))((((((......)))))).))))).)))))))}....,))))))})}))}.{((((((((((({.((((((((((((.(((((((((((((....)))))))((((......)))),....))).)))))))).)))))))....(((((.....)))))....}))))))))))},((((((...)))))).}})).}((((((((.(((((((((((({,,.......)),)))))))..))))))))...))))...((((((((((((((((((.(((..((((.((((((((((((((((((..((((..((((((((((((((((...((((((...(((((((((........((((((.(((.((((.((......)).)))).).)).))))))}}}.(((((({(((....(((((((.(((....))).)))).))).,,,)}}}...))))))........{{(((...((((({{(((((((((..,..((((.........)))).,,))))))))))))))...))).,}............((((((.,,,.....,,...))))))....))))))..))))))...)))),..}))))))..)))))))))..)))))))))))))))))))))).)))...))))))))))))))))))).))))))))
Forensic Context

No forensic context available.