Basic Information

Symbol
hsa_chr7_0010300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-EPHB4_0037
Host gene
EPHB4
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
7:100417847-100421398 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:100820225-100823776 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-279.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -287.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 124.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((....(((.((((.(((((((((((......))))..((((((((((...(((((...)))))......(((.((((.((((((.((((((((((((((..(((((((.(((((((..(((((((.((((..(((((((((.((((((...(((.((((.......)))))))....))))))))))(((((.....))).)).)).)))..)))).))))))).....)))))...........)))))))))..)))))...........).)))))))).(((((((((....))))))))).)))))).)))))))...))))).)))))..(((((....))))).....))))))).)))).))).((((((((((...))))).......((((.....))))(((((((.(...(((((((((.(((((((((((.((((((((..((((.((((((.((((.((.....)).)))).))).)))))))..))))))))..)))))....)))))).....((((.((((.......)))).).))).))))))))).).))))))).))))))).))))(......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.((....(((.((((.((((((({(({.,,,..}|||..(((((((({{..,((((({{{|||.),,||..(((.((((.((((((,(((((((({(((((..(((((((.{{{((((..(((((((.((((..(((({((((.((((((..{(((,{({(.......)))))))....))))))))))(((((.....))).)).)).)))..)))).))))))).....}})}},,,,.|||...)))))))))..)))))...,.......}.)))))))).(((((((((....))))))))).)))))).)))))))..,)}))),))}}),,({{|{.,,,))))).....))))))).)))).))).((((((((((...))))).......((((.....))))(((((((.,...((((((((({((({(((((((.((((((((..((((.((((((.((((.((,...,)).)))).))).)))))))..))))))))..))}}},.{{||||||{,...,,{|.||||}}}}..,))))}))))}.))))))))).).))))))).))))))).))))(......)
Forensic Context

No forensic context available.