Basic Information

Symbol
hsa_HOMER1_0001500
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0073128 hsa_circHOMER1_006 hsa-HOMER1_0001
Host gene
HOMER1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:78692646-78752841 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:79396823-79457018 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-192.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -207.9 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 208.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.