Basic Information

Symbol
hsa_HOMER1_0002500
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0073129 hsa_circHOMER1_005 hsa-HOMER1_0012
Host gene
HOMER1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:78697722-78752841 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:79401899-79457018 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-161.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -171.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.