Basic Information

Symbol
hsa_ERBB2IP_0000300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ERBIN_0093
Host gene
Erbin
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:65222410-65346794 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:65926582-66050966 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-556.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -607.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 596.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((..(((((((.....(((((.............)))))..)))))))..)).....(((((((..(((............)))..))))).))(((((.........(((((....))))).........)))))......)).))(((((....((((..((((((.(((.((.(.(((.((....))))).).))..)))((((((..(((((.......))))).......(((.((((..((..((.....))..))..)))).))).....(((((((...(((((.....)))))((((.((....))..)))).......(((((((((((.((.((((.............((((((.(((((.((((....(((((((....((((.((((((..((((........(((((((..((((((((.(((....)))))))...)))))))))))...............((((((((.....(((((...)))))...(((..((......))..)))...((((((((((..(((((((.(((((((((((((.(((((.((.((.......((..((((...(((((((.((.......((((((....)))))).....)).)))))))...))))..)))))).))).)).))))))).....((((.((((((...(((........)))(((((.....)))))((((((((((((((((((((......))))))......................)))))))).)))))).(((((....(((((......))).)).....)))))...))))))))))...((((((((........))))))))...((((((.....)))))).............))))))))).))))..))))))))))...))))))))(((((.....((((((((((((..((((..((((.......((((.((((((.........)))))).))))((((...(((((..(((((.....))))).)))))..))))(((((((((.......(((.(((((.((((((((((((.((((((((((((((..........))))).....((((((((((..((((((..(.((.(((...((((((.....)))))).....))))).)..)))))).....(((((((((...))))))))).....)))))))))).((((((....................))))))(((((((.((.((((.(((...(((((((....(((((((..((((.(((((.........))))).))))))))))).((((((((....((((...))))..((((((........((((....((((((......))))))....)))).......))))))..((((((....)))))).......(((.((((....)))).)))(((.....)))....((((((...(((((.......(((.....))).(((..(((.....)))..)))...........(((((((((.(((..((((..(((((...((((..((......))..))))...)))))..))))..))))))).))))))))))...))).))))))))))).(((((...(((.......))).)))))...))).)))).((((...))))(((.((((....)))).))).....(((......))).)))))))))))))))).....(((.(((....))).)))..................)))))))..)).))))))).(((.(((....((((((.........................))))))......))).)))......((((.....))))........))))).)).))).)))......)))))))))....)))).))))..)))))))))))).....))))).(((((((((.......)))).)))))))))..)))))).))))..)))))))))))..(((((((....)))))))((((((.((....)).))))))((((.(((((((((((......(((((.((........)).)))))............................(((((..(.(((.(((.((.(......).)).))).))))..)).)))))))))))))).))))............))))).))))))))))...)).))))))))).))((((....)))).(((((..........)))))..))))))).))))))(((((.........))))).............)))).))..))))...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((({((,((((((((.....(((((.............)))))..))))))),,,,.{{{{{{..,,,...(((({...({..{{{{({.((((((.(((.(((,..,,,,.(((((....))))),)....,{{{{|}}......,}}}}||||,..,{((.,{,...,.,..(((((....,,}))))....,)).}}}}}.})}))).)))))).)}}})},.}}))))}......,{{.((((..(({.((.....))..)),.)))){||,......)}},|{,{{{(({...})))))))).))))))..,...,,}|}}},}.,)})))((,{(((.(((.((.......(((((((({.(((,{((({(,{((,,,..,((((({...,({(.(((((,,...,|,}}}},.}||,,,||}}||,.,|||,|,|}}.,))})))},|{|||{|||},,}}},...}}},},{{(((((((.{,.....(((((((((,...{(((({.,,..........|||...((((((((((..(((((((.(((((((((((((.(((((.,{.,,.......((..((((...(((((((.({.......((((((....)))))).....)).)))))))...))))..)))}}}.)))},).))))))}.,..{((((.((((((...,,,........}},(((((.....)))))((((((((((((((((((({......})))))......................))))))))))))))}.(((((....{{(((......))).}}.....)))))...))))))))))}.}{(((((((........)))))))},,.{(((((.....))))))..,,......,,}))))))))).))))..))))))))))...,|||||||{{,,,{{{..((((((((((((..((((..((((.,,....{(((,(({{{{,,,......}})))).)}}}((((...(((((..(((((.....))))).)))))..))))(((((((((.......(((.(((((.((((((((((((.((((((((((((((..........))))},,...,{{{{{{{{{..((((((..(.((.(((...((((((.....)))))).....))))).)..))))))...,,(((((((((...)))))))))..,.,|||||||}}|((((((({{.,,....|.,,.......{((({((,..,,......,|,))))))}|||||{{.,..,||||||,,||{,.,,{{,......,,.|||||,|||||||}|||.((((((((....((((...)))}..((((((..,.....((((....((((((......))))))....)))).......))))))..((((({....}))))).,,....{({.{(({....)))).))}{{,.....}}}....((((((...(((({{{.....}},.,||..,}.|{|,.{||.....|||,.}},.,,.......{((((((((,,(((..((((..(((((...((((,,((.....,)),.})))...)))))..))))..))))))).)))))))))).,.))).))))))))))).{|||,},,||,},.,.,,))).,,,,,...{(({|....))))}.{||.,(((.((((....)))).)))..,.}}....,},,.}},}}||||,..||||,}||....{{{.{,.....}))..}},,..,,,..,}}}}}}}.))))))),.}).))))))),(((.(((....((((((....,{,.....,,,..........)))))).,.,,,)}}.)))......(({{.....}}}}........})))).))}},).))}......)))))))))....)))).))))..))))))))))))}}}.,,}}}.,|||||((((.......)))).)))}}|,....,,..,},.{((((((.,,,((((,((((((((,....|,}|||||{{{{(|{{....}|,}}}|||{(((.(((((((((((,.,,..,{(((.((........)).)))}|.,,.{,....}}.,}}.....,,,....{{{{{..{.(((.(((.,,.{......}.}}.))).})),...}.,,)))))))))))).)))}}}.....,,.,,}}.}}}},,|,,,.})}}}}})),))))....)))))))})))))))))))))).....}}.))))))))))))))))).....)).))).)))))),{({{.......)}}}.,{({{.|,.......,.))))}
Forensic Context

No forensic context available.