Basic Information

Symbol
hsa_ERBB2IP_0002800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ERBIN_0190
Host gene
Erbin
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
5:65243765-65245889 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:65947937-65950061 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-614.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -656.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 542.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))(((.(((.((.((....)))))))......((((((((((((((.(((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((...(((((..(((((.((((((((((((((((.....................)))))))))))...((((((.(((((((((((............))))).)))))).)))))).(((((((...(((((.......(((((((((....)))))))))((((((((((((.....((((((.((.((((.(((.((((((.((....(((((..(((..((..((((((((...))))))))..))..)))..))))))))))))).....((((((.(.(((...))).).)))))).((((.((((((..((((((((...(((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((.((....)).))))..))))..)))(((.((((((......)))))))))..........(((((((((((.....)).))).((((((((.((((.....)))).))))))))(((.....)))....))))))))))))......)))).))))))((((((((...))))))))............)))))))))).))))))...)))))......)))..)))))).))))))).))))....))..))))))...((((.((((..((....))..)))).)))).)))).)))))))))))))....)))))))....((((......)))).).)))).)))))...)))))...))))))))))))))))......(((((((.....)))))))........((((((((((((((.........)).)))))))..)))))(((...(((((.((((((.....)))))).)))))...)))((((((.(((....((......)).....)))))))))..............((..(((.(((((....(((....(((((((((((((((((((((.(((....)))(((((((....((.((((....)))).))....))))))).))))))))..)))).)))))))))...(((((........)))))((((.((((((..(((((((.....)))))))....(((((((((((((...(((((((((.......((.(((((..........)))))))((((.(((....))).))))...((((...((((((.(((((((....))))..(((.((((((((...))))))))..)))))).))))))...))))..)))))))))....)))))).))))))).(((((...(((......))).)))))...........((((..((((((....(((((.....)))))(((((((((((((((((....(((((((((......(((........))).........((((((((.........))))))))..((((((((....)))).((((((((((((((((((..((.((.(((....))))).))..))))......))))))))))))))......))))....)))))))))((((((((((((....((((((((.((((((...)))))).........))))))))..)))).(((((((((..((((((((((((((.......(((.....)))..(((((....)))))..))))))).......((((((.((((....(((((((((((....))))))))))))))).))))))............))))))).)))).)))))))))))))(((((((((.(((.............))))))))))))............(((....))))))))......)))))))))))).)))))).)))).........)))))).))))......((((.((....)).))))((((((......(((....)))....((((((..((....))...))).)))))))))..........)))....)))))))).))))))))).))))))))))))).)))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{{.{||,(({{{,.,..,|.....})))})}.}|.{((((((((((((((.((,{((((((((((.(((((((((((((((((((((({...(((((,.(((((.((((((((((((((((.......,....}........))))))))))}.,.((((((.(((((((((((............))))).)))))).)))))).(((((((...(((((({{,...{{(((((((....))))))|||{{({(((({(({,..,,((((((,((,({({{(((((({(((((({((,(((((..(((..((,.((((((((...))))))))..})..)))..))))},,,||||}.....((((((.(.(((...))).).))))))..||{.,||||,...,...,,,...,,{{{{,(((((,,,}}||}||||||||,,||||{}}||,,.{{,.|,...,}|||||...,,,...}},{{{.(((((|......})))))}))......{|{{|||||{{{{{,.{|||}}|||,,((((((((.((({.....)))).))))))}}|{,.....,,,...,{.{(((,|,,,,......,.,.}.)))).||{(((({.,,|||||}}}..,,}},,||,,{|,||||||}..}}}}}...}))))..,,,.,}}.,)))))).,,,)))).,))),..,))}})))))}...,{{{.((((..{,....}}..)))).}}}}.,}}}.)))))))))))))....)))))))....((((......)))).,.)))}.))))).,.)))))...)}))))))))))))))},..,.(((((((.....)))))))........{(((((((((((((.........)).)))))))..))))}(((...(((((.((((((.....)))))).))))).,.))){(((((.(((..,.((......},.,,..)))))))))......,.......((..(((.(((((....{{(.,,.(((((((((((((((((((((,(((..,.}}|(((({((....{{.{{((....)))),)}....))))}}}.))))))))..)))).))))))))).{((((((........))))))},{.((({((..{((((((.....}}}}))),,,.(((((((((((((...(((((((((..,.{{{((.{{,,,.,,,,,....||}}},,{|||,{{{....}}}.,}},...((((...((((((.((({(((,...,,,),}|((.((((((((...))))))))..))}))).))))))...))))..)))))))))....)))))}}})))))).(((((...(((......))).))))).......,,,{((((,.{{((({,,.,(((((.....)))))(((((((((((((((((,,,{((((((,,{.,....{{{......,,))),........((((((((.........))))))))..||{{((((....)))).(((((((((((((((({,..,(,((,({(,...})},}})}.,})},,,..)})))))))))))))).....,||||,,.,|||}|||},((((((((((({.{,.((((((((.{{((((...}}}))).........)))))))).,)))},({(((((({,.(((((((((((((({{{{...(((.....)))..|||||,...,,}},..}}))))).......((((((.((((....(((((((((((....))))))))))))))).))))))............))))))).))))))),)}))))))))(((((((({,(((.............)))))))))))).......,,,,.,,|..,,)))))))),.....)))))))))))),||||||.}}},.....},}})))},,.|||{,,{..,((((.((....)).}))}},}))))}}...(((....))).,..},}}}}|{{||,........,.})))),.,,),},,,,..}})))....)))))))).))))))))).))))))))))))).))))))))))))))),}
Forensic Context

No forensic context available.