Basic Information

Symbol
hsa_ERBB2IP_0004100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ERBIN_0123
Host gene
Erbin
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
5:65267866-65270021 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:65972038-65974193 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-533.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -576.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 579.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((((((((.((.....(((((((...)))))))((((.((..((.(..((.(((((.((((((((((((((((((.(((.(.....((((.(((....))).)))).....)))).).))))))))(((((((....((((..((((((((((.(((((((((...(((((((((.(((((......((((..(((((((.(((((((((.(.((.((((((....)))))).)).).))))).)))))))))))..))))(((((.((((..((.....(((((....))))).....))..)))).)))))...((....)).........)))))..)))))))))......))))((((....((((.......))))....)))).....((.((((((.(((((((((((((.((..........)).))))))).....))))))..)))))).))(((((((((((((((((((.(((((((....))))((((((((((......)))))..)))))(((((..........)))))(((((....(((((((((((((((...(((((((((.................((.(((...))).))..)))))))))...)))))..)))))..(((((((((((....((((((((((((((.....((((....(((((....)))))...))))......)))))))......((((.......))))(((........)))(((((.(((((((.(((.....((((((.((((((....(((((((....)))))))(((.(.((((((..((((.((((.(((((((...(((((.(.....(((...((((..((((.((((((((((((....((((((((((.........(((((..((((((((((((......(((((.((((.((......)).)))).))))).......)))))).....((((((....))))))((((.............(((((....)))))...........))))....(((((((((((....))).))))))))...(((((((.......))).))))........)))))).....)))))..(((.....))).....))))))))))))))))))))......))...))))..))))....)))....))))))...))).)))).))))(((((.((.((((....(((((.((........))))))).......(((((...(((((((.....(((((...(((..(((.(((....))))))....)))..))))).....)))))))...)))))....................................................)))).)).)))))..........(((((((.....)))))))))))..))))))).)))(((((..(.......)..)))))...)))))))))))).)))..))))))).)))))))))))).(((((((..((((.(((((.((((.((((..((((((......)))))((((((...))))))..........((((((((....((((.....((((((.((........)).)).))))......))))....))))))))..((((..((.((((.....)))).)))))).)..)))).)))).))))......).))))..)))))))..)))))))))))....)))))...))))).))).)))))))))))))))))))..)))))...))))))))))..))))..(((((((.......)))))))))))))).((((......))))((..((((((((....((.(((((......))))).))))))))))..))....((((.((((((((..((((...(((.(((.(((((.(...((((.(((((..(((((((.(.(((((.(((...)))...))))).)..)).)))))..))))))))).........................)))))).))).)))))))..)))).)))).))))..)))).)))))))))).)))))..)).)))).............)).))))))))).))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(((((((((,({,,..{(((((({...})))))).|(({(({,.({(..{({((({{.{,||||||{{((((((({.{,{.,,....{((({((({...,,)}))),.,,.,},},.),)))))))}(((((({....((((..((((((((((.(((((((((...(((((((((.(((((......((((..(((((((.(((((((((.(.{{.((((((....)))))).}}.).))))).)))))))))))..)))}{((((.((((..((,....{(((|....}}})}||.,,}}..}))),))))),..||....)}.........}))))..)))))))))......))))((((....((((.......))))....)))).....((.((((((.(((((((((((((.((.,.....,..)).))))))).....))))))..)))))).))(((((((((((((((((((.{((((((....))))||{,,{((((......})))}{{||||....})}}}}....,,}||,,(((((....(((((((((((((((...(((((((((...,,........{{{,...,,....))),))}.)))))))))...)))))..)))))}.(((((((((((....((((((({((((((,,,,{(({{.,}|||||...,.||}||.,,}}||,....,))))}))},,,..((((.......))))(((........))){((((.(((((((.(((.....((((({.((((((....,((((((....))))))|{{(,(,((((((..((,,,((((.((({{{{...(((({,{,....(((,..{(((..((({.{{((((((((((....((((((((((,{...,,.,((({{,,{((({((({{(({{,{{{(,(((({,(((,,.....|}}|))}}}}}}},,........,}.......((((((....)))))),,,{.............(((((....))))),,.{{......,,)).,,.(((((((((((....))),})))))))...(((((((.......))).))))......,,,,,,}},,..,,}}}}.,,,,{,....,....,.))))))))))))))))))))......))...))))..))))..,.}}}....})))))...)}}.)))).))))|{||{.|||{{{{,,..(((({.((.......})}))))}.......(((((...(((((((.....(((((.,,(((..(((.(((....))))))....))),.))))).....)))))))...)))))....,...........................,,.................,}}}),))}))))).........{{{{{{{{...,,})))}|||||||,}}}}||||}}|(|{||..|,..,}}},..})))),,,))))))}))))).}}}.|})))))).))))}})))))).(((((((,,(({{.{((((.{{{{.{{||},,(((((......))))),{{{{,...,}}}}}...,,.,.,{{(((((({....{{((,,,,.{{{{,{,.{,.......,,.},.))))....,,)))),,},))))))}}}}|{|{..{{.((((.....)))).})||||,|,,}}}}.)))},))))......,,)))}..)))))))..)))))))))))....}))))...))))).,}).)))))))))))))))))))..)))))...))))))))))..))))..{((((((.......))))))}})))))),((({......))))((..((((((((....((.(((((......))))).})))))))))..))...,||{|,|||||{((,.((((.,.(((.{{{.{|||{..{,,{(((,((({{..(((((((..,{{{{|.||{.....)}}}))),)})..},.}}}||,,||||||}}|..,......................|||,,,.)}),)|||||}..||}|,|||}.}})),,)})).)})))))}})})},,)}}))})))),}}))}})}....)}.})))))))).))))....
Forensic Context

No forensic context available.