Basic Information

Symbol
hsa_ANKS1A_0002700
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0076080 hsa_circANKS1A_005 hsa-ANKS1A_0004
Host gene
ANKS1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:34949467-34953055 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:34981690-34985278 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-229.14 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -242.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 166.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((..((((.......(((((((((((.((.((((((.........((.(((......(((((....)))))......))))).))))))...........((((.(((((((((((((((((.(.((((((...(((....((((((((((....(((........)))))))...))))))...)))...)))..............(((((((.....))))..)))...(((......)))))).))))))))).......(((((((.((((..(((....((.(((((....(((((((.(..(.((((.(((((((......))).)).))((((((((.....((((((.....))))))))).)))))...............)))).)..))))))))......))))).))....)))..))).....).))))))).....(((((((...(.((((((.((((.(((((...(((.((...................................)).)))....)))))))))..((((((.((((.((....))...)))).))))))....((((......))))......)))))).)....)))))))..)))).)))))....)))))).)))))))))))..)))).)).)))).)))((.(..(((..((((((((...(((((((.((.((.((((........)))).))..))))).....))))..)))))))).)))..).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.((..((((..,...,(((((((((((.((.{{{{{((({{.,,,,{|||||...,{{(((((....}))))....{{|||||,}|||||...........,((({({,{{{{{,((((((((.(.(((,{{...({{..,.((((((((((....(((........)))))))...))))))...|||,|........,..}}.....{{{{(((.....))))..}))...(((,.....))}))).)))))))))..,},,,{((((((.{(((..(((....((.(((((.,..(((((((.{..(.((((.(((((((......))),,).)),(((((((,{{..((((((.....)))))),,)},))))..,,,..........)))).)..})))))))......))))).))....)))..))},....,.))))))).....(((((((...{.((((((.(((,{(((((...(((.((.........,.........................}).)))....)))))))))..((((((.((((.{{....}}...)))).))))))....((((......))))......)))))).)....)))))))..}}}).))))),.,.),,,)).))))))))))),,)))).)).)))).)))((.(..(((..((((((((...(((((((.((.((.((((........)))).))..))}}},,,,.})))..)))))))).)))..).))
Forensic Context

No forensic context available.