Basic Information

Symbol
hsa_ERBB2IP_0020500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ERBIN_0066
Host gene
Erbin
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:65338905-65371058 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:66043077-66075230 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-597.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -653.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 669.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((....))..((......((..(((((....((((...(.((((((.(((((.((.....((((((.((((((...(((((.(((((((...............(((((....))))).(((..(((.((((....)))).)))..).)).....(((((.(((((..((((((..(((((.((.(((....(((((.......(((....)))........))))).........))).)).)))))..((((((.........................)))))).(.(((.....))).)...((((.....)))).........((((.(((.(((((((..(((((....((((.(((((....((((.((((.....))))(((((((..(((((((((.......)))).)))))............((((((.(((((....((.((((((((((.........((((((.((....)).)))))).(((.(((((((((((......(((((.((........)).)))))............................(((((..(.(((.(((.((.(......).)).))).))))..)).)))))))))))))).)))))))...))))))))....(((((((......)))))))(((((((...((.(((((((((((((..........))))).....))).)))))))(((((.........)))))................................((((...(((((....)))))....))))........)))))))..........)))))..))))))..(((((.((((.((...........)))))))))))..((...((((((((....(((((((.(..(((((((.(((((((((...(((((((.(((.((((....)))).)))...((........)).....)))))))...))))))).....)).)))))))....).)))))))...))))))))...))...........(((((...((((((((((......))))))))))..)))))...((((((((((.(((..(((....(((....((((.((((....((((((((((...........)))))..))))))))).)))).(((((((((((.((((((((.(((((..(((((........)))))......((.....)).......((((.(........).))))....))))).))))).....((((((((....))))))))...))).)).)))))))))...((((.........((((((..((.((.....(((((.(((((((..........................)))))))((((.....((((((.(((..(((....)))....)))))))))......))))(((((((......(((((((((......(((((((.....)))))))....................((((....)))).......)))))))))............((((........))))....)))))))............)))))....)).)).))))))........))))((((((((((((...)))....))))))))).............)))......))))))))).)))))))))))))).))))......)))))((((................)))).....))))....)))))..)))))))..))))))).))))))))))).)).))).....)).)))))))))))))))))))).)).....((((((....(((((((((..............(((((....((.(((((..(((((((((......((......))..((.((((......((((.((((...(((((....)))))...)))))))))))).))..((((((.(((((((.....))).....((((((((..(((...)))..))))).)))...((((((..((((((((((((....))))))...................))))))....)))))).......((((((((((...((((..((......))..))))..((((.....)))).((((..........))))((((((((((((((...........)).))))))))))))))))))))))........)))).))))))........(((((((.......))).))))..)))))))))..))))).)).....))))).......(((.(((((..(((.....)))..)).))).)))(((.((((((.....))))))...)))..............(((((..((..((((((...((.(((((.((.(((..(..........(((((((((((((...(((.(((..(((.((((...))))....)))..)))...)))...))).)))....((.(((....))).)).))))))))..))).))))))).))...))))))..))..)))))..)))))))))....))))))..........)).))))))))))).).))))....)))))..))......)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{,,,,,|,..{{..,,,,((,.{({{{....{{||,,,|,{(((({{(((((.((.....((((((.((((((...((((,,(((((((...............(((((....))))).(({..(((.((((....)))).)))..}.)|,{{,{((,{(,(((((..,,,{,(((((....{(.((({...,,{{{.......,,,....,,)},,.,}}})},},,,,.|||..,..,}|.|||,...{{{{{{....{||.....,,,..........))})))}}}}}...,,}},.....,{,,{....,||||...,{{,..((({{(((.(((((((..(((((,.{{(((..(((((,.,.({{(.((((.....)))}(((((((..(((((((((.......)))).))))).......,....((((((.(((((,({,((,(((((({{,,.,,,,||,,|{{{{(.((...,}},}}}|||{(((.((((((((((({,,,..,{(((,((........)).})}}|,,,.{,....}}.,}},....,,.....{{|||..,.{({.(({.,,.{......}.}}.)}}.}}}|...}.,,)))))))))))).)}}}}}}...}}}}}}))....(((((({......))))))){(((({{...((.(((((((((((((..........))))).....))),})))))){{{{{........,})))}.......,,....,{{,............,,,((((...(((((....)))))....))))........}))))))..........)))))..))))))..{{{{|,{{{,,{,.,........,}.})),}}}}}..((...((((((((....(((((((.(..(((((((.(((((((({...((({{({.(((.((((....)))).)))...||.......,}|{{{{,,}}}))),,.))))))}....,)}.}))))))....}.)))))))...))))))))...))...........{(((,...((((((((((......))))))))))..}})))...((((((((((.((({{((,...,,{{,..|||||.,{{..,,,})},.|||||......,....,||||,.{(((((((........((((((,......})}}}}...,{{..,{{{|,,...,}}}}))}{.{{{,((,....,,..,,},}}}}},},,......)))))))}..||{{|{|,,{(((.,.((((((((....))))))))...||,,,.{((,{{{((((((((((....((({(.,,,,{,..,..}},.}}}}}{{((((((((..,{.....................,)))))))),||.....((((((.(((,.(((....)))....)))))))))......}},.{((((((......(((((((((......(((((((.....)))))))....,{...........,||{({{....})},.......)))))))))..........{.((((.,....}.)))),...))))))}...........)))))))))},.{{{{........)))}.||.{.(((((((((({{...},,...,))))))))).,.......,}}.))),...},)))))))))))))))))))))))).)))),,.},.))))){{{{.,,,........,|,.}))).....))))}.,.)))))..)))))))..))))}}).})})),,}))}..},))).....))}}})))))))))))))))))).)).....((((((....(((((((((.,............(((((.,,.({.(((((..(((((((((.....,(.{(({......,,}|}}|,,|.,.((((.((((.,.(((((....))))).,.))))))))}}||{,.,.{(((((.((({{{{.....|||,,...({((((((..(((...)))..))))))})}...||||{{..{{{({{((((({....}))))).................,,}|}}|}....})}))}.,..,,,{(({{{{{({,||{{{{,,,..,,.......}|}|||,((({.{{{.||,{((((,....,,,}})})){|||||||{|||{,...........}}.})))))))))))})))}}})}}........}}|}.}})))}..,,....(((((((.......))).))))..)))))))))..))))).})...,.))))).,.....,{{.{((,(..(({.....}})..)).))).}||(((.{(((((.....))))))...)))},..,,.....,,.(((((..((..((((((...((.(((({{((.(((..{{{{{..,...((((({.{(((,,..{(,,.((({{(((.{{{,...,)))}...|||..,,,...)))...,,),))..,...}}|}))))},}..,,}})))).,...))).))))))).))...))))))..))..)))))..)))))))))...,))))))..........)).))))))))))}.}.}}}|,,,.}}}})}})}.,,}..,,.
Forensic Context

No forensic context available.