Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0007200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0135
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107580944-107602800 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104818663-104840519 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-949.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -998.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 745.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.((((...(((((((((((((....((((((......))))))....))))...)).)))))))((((((((.....(((..((((.(((.(((((...((((....))))...)))))((((((((((..((.....(((.((((.......))))))).....))....))))))))))(((((...(((((((.....)).)))))...)))))...................(((((((((..(((((......))))).(((......))).((((((.(......).))))))((((((.(((.((((((.((((((((.....((((.(((((((.((((.(((((((.(((((.(((..((((((((.......))))((((.....(((((((.((((((((((((((...(.((.(((..(....)..))))).).))))))...)))))))).))))))).....))))..((((((...((((((...)))))).))))))(((.((((((((((.....(((((..........))))).....))))))).....((((.......))))(.(((((((((....((..(((((((((((((.(((.(....(((((..((...(((.....))).))..)))))....))))))))).....(((((((((((((.((((..((......((((.......))))......))..)))).))).......))))))))))))))))))..)).....))))))).)).)...))).)))(((((.....))))).))))..))).)))))((((..((((((........(((....)))..))))))..)))).((((((................((((......))))..))))))(((((..(((((..((.(((.....)).).)).)))))))))).(((.((..((((((((((..((.(((((..........((((((....))))))(((((((....((.(((......))).))((((((((.............(((((((((....((((((((((....(((((((..((...((.....)).))))))).))..)))))).))))..))).))))))))))))))((((.(((..(((((((((.((.((..(..((((((((((.(((((((..(((..(((((((((.((((....((((........(((((....(((((((((..((((.((((((....)))))).))))...))))..)))))....)))))....))))....)))).).)))).))))..))).)))))))))))).)))))..)..))..)).)))))))))..)))..)))))))))))....((((...)))).(((((..((((((..........))))))))))).)))))))))))))))))..)))))((((((((.(((.(((((..((........))..))))))))))))))))....)))))))...))))))))..))).))))......)))))))).))))))))).)))))))))))))))))).))))....))).....))))))))...((((((...(((((.((((((((((((.(((.(((((((...((((..((.....))))))..)))..))))))).)))))))((((((((((((((((.(((....((((...)))).......((((...)))))))))))))))))).)))))))))).))))).))))))..(((((....)))))..((.....)).....((((((.(((((((((..((((((((((((((((((.(.(((.(((((((....(((((......)))))....((((((.((((((.((((...((.(((((.((..((....))..))))))).....((((....((.....))..))))(((((..(((((((.(...((((....)))).))))))))..))))).))...)))))))))).))))))((((..((((....((((......)))).((..((((......)))))))))).))))((((((...))))))(((((((.......))))))).....((((((.((((((..((((((...(.((((((...)).))).).)..))))))..))))))))))))...)))))))(((((((((......)))))))))........))).))))))).))))))))...(((((........)))))...(((((((...((((((........(((((((......))).))))((((((((((((((.(((.((.((((....)))).)).)))(((....)))......((.....))))))))).................((.(((((((((...((..((((((.....))))))..)).))))...))))))).)))))))....((((.((..((((.....(((......)))..))))..)).))))..))))))...)))))))......))))..))))))......))))))))).(((((......))))).))))..)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{.,,,||{..(((.(((((((((,((((..,.((((((......)))))).,..))))...,.})))))))).))).............{{(({.(((.((..(((((((((((((.{,...(((((((({((((((..(((((((((,{{((((((.,..((((((.....,..{{.,{{{{((....)))))..,,(((.(((((,{(.((..({.....,,...,.....})..}}.})))))).)))...{{{{{.,....,..,})}}))),..)))))).((((({......{{{{{,,{,{{{{,,{(,.,,||||,{{{((({{.{{.{((...(((((.{{,,.{(,(((....}}}.}},..,)},},})))).}}}.)).)))))},,...(((((((.{(((((((((((((...{.((.(((..(....)..))))).}.))))))...)))))))}.))))))),(({.(((.(.((((((...((((((...)))))).)))))).).))).))))))))}.}.))))))),.))))).))))...))))))...{((((.{{{{.{{{{{{||||{{,,(((((((..,.((..(((((((((((((((((.(....(((((..((...(((.....))).))..)))))....})))))))).....((((((((((.(,(((,....(({...{((((({.....,.......,..,))))))}..)}}))}}.))))))))))))))))))..)).}...))))))),||||.{(((.(((.{((((.....))))|(((((.....)))))}((({,,(((((({,.,,...,{{...,)})}.)))))).,)))).)}).))},.....,{{..,|.,((((.{((({{{((..{((((((((.....,,,|}}}}}}}}..}.})}.|{||,{||{{((({{.((({(({((((((((((,({,({(((((...,{.{{..((((((....|||}||,,||,||....,{|{({||....|,,.|||}}}}}.....})))),...}}.)},)))))...})})})))}.....,,}}}.,,.)))}}}}|.,},}}}|((((((((((....{{(((({{{{{,|.{{{{{{||||,,,.((((.(((..(((((((((.((.((..{..((((((((((.(((((((..(((..(((((((((.((((....((((........(((((....(((((((((..((((.((((((....)))))).)))}...))))..)))))....)))))....)))).,..)))).).)))))))))..))).)))))))))))).)))))..}..))..)).)))))))))..)))})))||||||,,(((((((((....(((((((({,,((((((,.........,||{{{{..|{.{{{(((|{{{{,|,,,,,,)))),..))))))))..})))||..,,........)}})))))).)),)))))))).....)))))}}}))((((.((((({..,,(..((((((,{{,...))).))))))..),,,)))))).)))}...,,....,))})}((((((((((((((((((.(((.....(((.....))}.....))}.)))}}.......}})))))))))))}})))))},}))).))))))),,,,....))))))))))}..,,....)))})}}}}{,{((((((((((((.{((((.{{...,)))}}})))))))))))}...,,..|{||||..{||||}}..,||}|.........((((((,,..{{{.(({((((,,.((((((((((((((((((({(,(((.(((((((,..,{((((......))))}.}..((((((.((((((.(((({,,((.(((((.((..{{....})..))))))).....{{{{....,|},||,,...))}}(((((..(((((((.{...((((....)))).})))))))..))))).})}),)))))))))).))))))(,((,..,,,.,}}{|||,,...,)})),}{{{(((({,,...|||||||,,,.})))||((({...})))}}(((((((.......))))))).....((((({,((((((..((((((...,.{((({{...}),})).).}..))))))..)))))))))))),,,}}))))){((((((((......))))))))}........,,,.))))))).))))))))...{.(((((,.......{(((({{{((((((({((((({{{,{{{||{{,..{{,,|,,,)))}}.}||{((,{.,{||}|}.(((.{{.((((....)))).}}.))){{|..,.))),.....}},,))))))))}},,....}}}))},,.{{{,((.((((({{((...((..((((((.....))))))..)).})}))..))))))).,,,)}}),,,.)))))})))))),)))))))))...,|}}}}}})},.{(((......)))).}))))))}},},,.)))))....,)))))))).)}.)))))))}.,)))))..))))).},,,,...,))),....}
Forensic Context

No forensic context available.