Basic Information

Symbol
hsa_chr6_0247500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ESR1_0035
Host gene
ESR1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
6:152087982-152090354 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:151766847-151769219 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-588.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -633.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 566.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((......))).))))).((((....))))...(((.((.((((((((.......)))).))))...)))))..((((.(((((((((((.....(((((.((((((..(((...(((((.....((((....((((((((....((((((.......)))))))))).))))..))))...(((((......)))))(.(((((.((((((..((((((((......)))))))).....(((((((.((.(((.(((.(((((..(((((........))))).....))))).))).))).))...(((((((.....((((((((((.....((..((........))..)).)))))))..)))....))))))).))))))).(((((((((((((.(........).)))))))))))))...(((...((((.(((.(((......))).)))))))....)))...(((((....)))))............)))))).))))).)...)))))...)))..)))))).)))))((((((((((((((((((.(((((.(((((.....)))))...))))).)).....))))))))).............((.((((((..(((((...((((((((((...(((.((((.((.((.(((..((((....((((......))))..))))..))).)))))))).)))...))))))))))................))))).....)))))).))......((((((....((((((.((((.((((((((.((((...............)))).))))))))))))((((...))))....((((......)))).((((((((((.((((((((((.........))))).)))))))))))))))..((((........)))).(((.((((((((((.(((((((.......))))).....)).)))))).......)))))))..(((((((((((...)))))(((........))).(((((((............)))))))........)))))).....))))))....))))))............((((((((.....(((((((..((.((((...(((((((((..((((..((((.((((.(((((((((...((((...((((....(((((((((((((((((((.....((((.....)))).....))))((((........))))...........(((((.((((.......)))).)))))..((((((....))))))((((.((((((..((((((((..........(((((....((((((((((((((((((............((((.......)))))))))))))).)).(((...((((((((((((((((((((.((((......((((((((...((((.((((....(((((.((.((((((((.........)))))))).)).))...)))....)))).))))))))))))(((((.......(((.(((.((((...(((..((((((.....)))))).)))...))))..))).))))))))....((((((((.........................(((((((((((((.......))))))))..))))).)))).)))).........((((((((((..(((.........)))..)))))))))))))).)))))))))..)))))))))))...)))..((((((...))))))..).)))))..)))))(((((((.(((.((........)))))....)))))))...)))))))).....(((((......))))).(((((((((......)))).)))))......(((((((..(((((.........)))))..)))))))((.(((....))).))..........)))))).))))...........)))))))).)).)))))....)))).)))).)))))))))..)))).))))....)))).....)))).....)))))...))))))...)))))))..))))))))..))))))).))))))))))).)))).(((((...((((...(((((.....((.(((...))).))...)))))..))))..))))).(((...(((.....)))...)))....(((((.(((((.(.((((((((((((............((((((((....((.(((((((((((((...))))))))))))).)).......))))))))))))).)))))))...............).))))).)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.((((((((......)))}})))).((((...,|}}}..,{({,{(.((((((((......,}})).)))}.,}))}}}..{(((.(((((((((((.....{((((.((((((..{{{...(((((.....((((....((((((((....((((((.......)))))))))).))))..))))...(((((......)))))(.(((((.((((((..{({{{{((.,,,..}}}})))},,...(((((((.((.(((.(((.(((((..(((((.{|...},))))}.....))))).))).))).))...(((((((.,,..,{{(((((({.....((..((........))..)).)))))))..}}},,..))))))).))))))}.(((((((((((((.(........).))))))))))))).{.{{{...((((.{({.(((......))}.))}))))....}}}...{{(((....))))}.........,,.)))))).))))).)...)))))...))),.)))))).))))}{{{{{{{(((((((((((.(((((.(((((.....)))))...))))).))}....})))))))}.|{,.........,,,{{(((({{{{{{{...((((((((((...(((.((((.((.{{.(((..((((....((((......))))..))))..))).}})))))).)))...))))))))))....,.,{{,,,.{{||,.....,}}),)))),|||,....{{{{{{....((((({.,(((.((((((((.((((...............)))).)))))))))))}{|{,...}}}||{,.((((......)))).{|{{({((((.((((,{((((....,,,..|||||,||}}}}}}|}}}}}}..((((.....,,,)}}}|(((,,((,,,,,,|,.|||||(,,,,,,.}}}}},..||||,||}|||||.....,,,,,,,..|||||||||||,,.)))))}||..}},...,}}.(((((((............))))))}......||}}}}}|.....)))))),,..))}))}.........,,.((((((((.{{{.({(((((,.,,.{(((...((((({({,.,{{{|..((((.((((.(((((((((,,,((((...(((({{,.(((((((,(((((((((((.....((((.....)))).....))))((((........)))).....,,{,{{{{(((,(({{.,...,,||}}.}}|||.{((((((....))))))|{{||{{{{||||((((((((,.......,.(((((.,,.(((({.{{((((((((({,,.....,...{((((.......)))))))))))))).}}.|||...((((((((((((((((((((.((({...,..((((((({..{((((.((((....,{({{.((.(((((((({,...,})})},))))).)).}},..},,....)))).))))))))))))(((((.......(((.(((.{(((...(((..((((((.....)))))).)))...)))}..))).})))))))....((((((({.....,{,..............,,.{((({((((((((.......))))))))..}}})),)))).)))).........{(((((((((..(((.......,.)))..)))))))))}}))).)))))))))..)))))))))))..,|||..((((({...)))))).,),))}}}..)))))(((((((.(((.((........)))))....})))))).,.)))))))).....{((({......))))},(((((({((,.....}))).})))),,,.|,(((((((..(((((.........)))))..))))))),{.{({....))}.)},,....,,}|))},||{||,....}}},},,,}))))))).))},))))..}})))).)))).)))))})))..)))).)))).,,.)))),....))))|,...))))).,.)))))}},,})}))),..)))))))),.}}}})},.))))))))))).}))}.(((((...((((,..{((((.....((.(((...))).))...))))),})))}..))))).{{{,,,|||.....)}}...}}}.}|.(((((.{((((.{.((((((((((((............((((((((....((.(((((((((((({...})))))))))))).)).......})))))))))))),}))))))............,..,.))))).))))).,
Forensic Context

No forensic context available.