ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_ESR1_0006000
Basic Information
Symbol
hsa_ESR1_0006000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ESR1_0050
Host gene
ESR1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
6:152281589-152281990
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:151960454-151960855
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-106.50
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-116.27
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
70.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((..........))(((((...((((......)))).(((.....)))((((.....(((((((((((..((.(((((.(((((((....((((((..(((((.......))..)))..))))))....((((.(....(((.(((....((((..((((........(((((((((((((.........)))))..............(((((....)))))))))))))))))..))))..))).)))).))))...((((((((((((((....(((..........(((....))))))........)))))))))))))).)))))))..))))).))..))..(((...........)))...)).))))))).....)))).........)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((.,.....,,.))((((({,,(({{....,.)))).{((.....))|((((...{,(((((((({,,..((.(((((.(((((((....{(((((..((({(.......))..)))..)))))}....,{{.,{{{.,(((.(((....((((..(((,.......{(((((((((((((.........)))))....,{{,...}}}{((((....)))))))))))))))))..))))..))).))))})),)...((((((((((((((.,{,((({,......,.|||....}}},}}........)))))))))))))).)))))))..))))).))..||..(((...........)))...)).))))))).}...))))}........)))))
Forensic Context
No forensic context available.