Basic Information

Symbol
hsa_ESR1_0006600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ESR1_0032
Host gene
ESR1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
6:152315364-152316151 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:151994229-151995016 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-177.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -191.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 207.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((.((((((.....((((.....))))..........((((((.((((......)))).....((((((....(((..(((...(((.....)))..)))..))).....))))))(((..(((((...........))))).))).....((((((((....)))..)))))..))))))((((((..(..(((((((.(((...)))...)))))))..).)))).))..................(((((((((...((((((..................(((.....))).((((((.((........))...))))))...((((((((((.(..((((.....))))((((((((((...........))))).)))))).))))....))))))...((((.....))))((((((....)))))).((((.(((((((((....)))))))))))))...............))))))..)))).)))))......(((((..((((...(((................))).))))))))).(((((((((((.(((.....(((((((((.((((.(((..((((((((....))))....((((.((((......)))).))))..((((((......)))))))))).))).)))).))))).))))....)))..)))))))))))..........................))))))..)))))))).............(((((......))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((((.((((((.....,((({...{||}|,.,..{{{{|{{||{..{{{{.....,}}}},|,,||||,,,.,|||||,,|{|,..{{({{{,,|||{,|||{{||,.....,|||||(({..|{{{{..,,,......,},}|.........,,,,((((....)))}.,},,},,|,..||||||||..{..(((((((.(((...)))...))))))),,|,||||,|......,,{{{,{.....,{{{({{,.......{||,...,,......|||,.,}{{{....,)|},((((((.({........))...)))))),,.(((,.(((((....((((.....)))),||||}.||||,,,,,,,,}.))}))}}))))},))}}..,}))))},...{{{{.....))))((((((....)))))).{(((.(((((((((....))))))))))))}................,.}))},,.))})))}.....}}))})).,,,.,..,{{{.{{|||..........}}},}}})}}},..(((((((((((.(((.....(((((((((.((((.(((..((((((((....))))....((((.((((......)))).))))..((((((......)))))))))).))).)))).))))).))))....)))..)))))))))))..........,,,}}}..,}}|||..)))))}..)))))))).....,,......{((((......))))).....
Forensic Context

No forensic context available.