Basic Information
Symbol
hsa_FAM120A_0003000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0087536
hsa_circFAM120A_014
Host gene
FAM120A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:96233423-96318873
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:93471141-93556591
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-649.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-685.53 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
671.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.....)).((((((((((.(((((((.....((((((((.((..((((...(.(((((...(((((((((..(((((...........((((((....................)))))).))))).....)))))))))))))).)......))))..)).)))))))).)))))))..)))((((((...))))))(((......)))......(((((((......(((((((((((.....(((((((((((..((..((((.((((((((((((((.(((((.(......).)))))...........((....(((((((.(((((.(.....((((((((((.....((((((((((((.(.(((.....))).).))))))).)))))....))))))...((((((((((((((...(((.......))).....))))))).)))).)))..((((((((.((.(((((((((.........))))))))).......((.........)))).))))))))...................))))..).))))).)).)))))...))..((((((.(((.(..((.(((((((((((((((.((.........(((((....))))).......((((.((((((....(((((((........)))))))..)))))))))).....(((((....((....((((.........))))....))......))))).)).)))))).))))..)))))))..).))).))))))....))))))))))....((((((.....))))))....(((.........))).(((((((((..........(((((((....((((.((((((((((((..((((.(((.((((((.......(((((.((((((.(((((((.((....((((....(.((........((((.((((....(((((((.((.((.....((((..(((....((....((.(((((.........(((((..((.....)).)))))))))).))...)).....)))..))))..((((.((....(((((...)))))))...)))))))).)))))))....))))))))...)).)))))...)).))...))))).))))))..))))).....)))))).)))..))))..)))).)))).....)))))))).((((((....)))))).)))))))(((.....)))..............(((...(((.....)))...)))......(((......))).))))))))).((((.((((.((((..(((((...(((.(......(((((......)))))......).)))...)))))..)))).)))).)))).....)))))))))).))))))........))))).....))))..)))))))......)))))))..)))))))..(((((..(((((((((((....).)))))(((((((((.((((.(((..(((((((((((((((((((((.((((.((((((((((.....((.((((((.(((((.....)))))(((((.(.(.((....)).).))))))....(((.((((.(.((((((...(((....(((((......)))))....)))...))).)))))))).)))......)))))).))(((((..(((((((........))))))).)))))))))).......)))))..)))).......((.(((..((((....))))..))).))(((....)))))))))))).)))).))))))).)..))).))))...((((..((((((((.........))))))))))))((((...((((.((....)))))).)))).........(((((.....))))).)))..))))))....))))))))))....)))(........(((((........))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({.....||,((((((({(,.(((((((.,{.,{{((((((,({.,(((({..{,({{{{|.|((((((((({.(((((.....,....,(({,,{,},,...,,,,........|||||},.}}})).....}))))))}})},,.})}}....)}})..}},))))))}}.}}}}}}}..}}}{(((((...)))))}(((......))),....,{{{{{{{......{{{{||||||,.|}},||||{{{{||,,}||}}|{{{,{{{((((((((,((,(((((.(......).))))).{{(((({...((((,..,..{((|({((({{,.,,.(({(((((((.....((((((((((((.(.(((.....))).).))))))).)))))....}}))}}...((((((((((((((...(((.......))).....))))))).)))).))}..,(((((({.,|,||{{{{{{{...,,,.,,,}}))))),...,,,.|{,,||||,,.},)),})))}}}},,,,,.............{|{,{{{{,||,}}.},}))}))..})}..||||||,{((.{,.((,((({{{{{({{{{{{,|,.........(((((....))))).......((((.((((((....(((((((........)))))))..))))))))))...,,(((((,{,(((,,..{({(.,{{,,,{{|}},..,,|}...,},)})||{||{,}}|||,||}|.,|||}|||,.,.}}..,,,||,....}}|||||||,....(((({(,.,,,}|||}}...,||{,,,,....,))).,((,(((({{{{({(......|{||...))))|}.|||}|||||||{}}||,|.|||||||||}}},....(((((.((((((.(((((((.({....{{{{..,.(,(({,.{..{{(((({((((....{{{(({,.{||,{,,...((((..(((..,.((....{{.((((,.........(((((..({....,)}.)))))))))).))...})..,..)))..))))..{{|{.{{|...{{|||.,,}))))))},,))}}))}}.)))))),,,,,}||}}}}),..,,.}})))...)).))...))))).))))))..))))).....)))))))))|{{||||{{|||,.||||.....,.{||||,.,,,,,,}}}}),||||{{{.{{{{(((.....}))},{{,,,,.....,|,|}}}||,,,.}})))}).,}|,.....||,},}}.})})}))))))))}.((((.((((.((((..(((((.,.{({.,.{..{.(((((......))))).,..}.},}}....)))))..)))).)))).)))).....}}}}}}}},|,}}|}}}..,,....||}}|,.||.,,}).,))}}})),.....}}}}))}..))))}},..{{{{|..|||||{||||{....),,}|||(({{({((..,,{{,||,.}||||||||||||||{{|||||,{||{,{{{{{{|{{|.,..|||,{{{{{{.||{||...,.|||||,,,||}|}|.||....|}|.|||||||,...{({,(((,,(,((({{,..,(((....||||{...,,.)))}}....)))...})),))}})))).))),|||.,||||}}.||(((((..(((((((........))))))).)))))))}},......|||}}},,|}}|,{{.,{{({.(((..((((....))))..))).}}(((....))),,,}))))),)))),)}}}}}}.),}))).||||,{,,{{{..|||||||,...},}}}.)))|||||||,,.(((...,|||.,...}}))))),,))))}}....,}},||||},,,.}}}}..,},..,})))),,,.))))))||||......,}},......(((((........))))))
Forensic Context
No forensic context available.