Basic Information

Symbol
hsa_FAM120A_0003200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0087538 hsa_circFAM120A_016
Host gene
FAM120A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:96233423-96324586 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:93471141-93562304 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-905.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -950.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 833.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((((..(((((((((.(((((((.....((((((((.((..((((...(.(((((...(((((((((..(((((...........((((((....................)))))).))))).....)))))))))))))).)......))))..)).)))))))).)))))))..)))((((((...))))))(((......)))......(((((((......(((((((((((.....(((((((((((..((..((((.((((((((((((((.(((((.(......).)))))...........((....(((((((.(((((.(.....((((((((((.....((((((((((((.(.(((.....))).).))))))).)))))....))))))...((((((((((((((...(((.......))).....))))))).)))).)))..((((((((.((.(((((((((.........))))))))).......((.........)))).))))))))...................))))..).))))).)).)))))...))..((((((.(((.(..((.(((((((((((((((.((.........(((((....))))).......((((.((((((....(((((((........)))))))..)))))))))).....(((((....((....((((.........))))....))......))))).)).)))))).))))..)))))))..).))).))))))....))))))))))....((((((.....))))))....(((.........))).(((((((((..........(((((((....((((.((((((((((((..((((.(((.((((((.......(((((.((((((.(((((((.((....((((....(.((........((((.((((....(((((((.((.((.....((((..(((....((....((.(((((.........(((((..((.....)).)))))))))).))...)).....)))..))))..((((.((....(((((...)))))))...)))))))).)))))))....))))))))...)).)))))...)).))...))))).))))))..))))).....)))))).)))..))))..)))).)))).....)))))))).((((((....)))))).)))))))(((.....)))..............(((...(((.....)))...)))......(((......))).))))))))).((((.((((.((((..(((((...(((.(......(((((......)))))......).)))...)))))..)))).)))).)))).....)))))))))).))))))........))))).....))))..)))))))......)))))))..))))))((((........))))...)))))))).....(((.((......))))))))(((((...((((((((((((((.((((((....(((.......(((((.(.(((.....))).)))))).....)))....)))...))).)))))))))((((((..(((((......((((..(((((((((.((((((((..((...(((((((...(((((((((...(((((((((.......))))...))))).)))))))))...)))))))...))...((((((((((((((((((((..(((..((((....))))..)))........(((((....((((...)))).)))))((((((((.(((((((......)))))))....(((((((.((((((((...(((....))).....)))))))..).)))))))..(((.((((....)))).))).....((((...........)))).......))))))))(((((........)))))))))))))))))).)....)))))))))))))).))))))).))..))))(((((.((((....)))).)))))....((((((((...(((((((((((((...((((((...((((((((..((.....((((((.((...((((((((((.((((...))))..))))))((((((((((((..((((...(((......(((.(((((.((((((((((((.....))...))))))...)))).))))).))))))....)))).)))))))))))).....((((((.((((....(((((....))))).(((..((...))..)))...(((((....))))).............)))).))))))....))))...)))))))).))))))))))....)))))).(((((.....))))).)))))))))((((((.((....)).)).))))))))...))).)))))...(((((((((((((.......)).))))....))))))))))))..)))))).((((.....))))..)))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((...,,||,,,,,(((((..(((((((.,{.,,{(((((({(,.{(((((.,({(,,,||,|((((((((({,(((((.........,|{{{,,{,},,,,.,{{{...,,..,{||||,,.,,,}}.....,)))))),,)).,.})}}...,)},}.,},})))))},,.}},},,},,,},((((((...))))))(({..,,,.}}},....,...,,,......,||,,}}}}}}..)))))})}..,,}|,||}|}}}..})))}{|||,,,.....(((((.(......).)))))..........|({{{,.{{{.|||,{{{{({{,.,.,((((((((((,,,..((((((((((((.(.(((.....))).).))))))).))))}....}|||}}...((((((((((((((...(((.......))).....))))))).)))).))}..,(((((({.,|,{{{{{{{{{,..,,..,,}}}))))}}...,,..{{..,,,|,..},}}.})))}}}}...{{.,,.,.......,{|||{{{,.|||||,||,}}})),.,}}||||}.||||(({,({({.{((((((((((,((({{{,.....,..(((((....}))))..,...,((((.(((((({.,.(((((((.{{{{.{{||,}}))},))))},}))}.....||(((.,,((({{{{(({{.{{{,,,{{|||.,,,,|,...})}),)))||}..,}))|,))}}.|)||,|||,...||....{((({.....,}||||({....||,|||}}},,,|||||{(,((((......((((((((((.,,((,....{((((((({{(((((((({{,...,||{{{(,,{{{{{{,.{{((,.{{....}}..}})|,((((((((.(((((((((.............(((((({...({{({((((((((((,.,{((({(,{.,{({(.(((({{((,.(({{(.,..,{{((.(,.........(((((..(({{..{{{.|,||||,,,|,)},,}}}..}}.))){.{((((.((({.((..,.(((({...)))))})...)))),)))})|}|||,{{{{.{{|.,,|,.....}.))).}}}}.,,...,}}),,))),.,..).)))..}}}))))),)))|((((((((({(..((((,......(((((........))))).(((((((.{{{,(((.....)))|,(({{,{,....,}.,}))))}}}.)))))))...{{.....)}.)))).))})))))))))}..((((.((((.((((..(((((.,.(((.,.,..,.(((((......)))))....}.,,))....)))))..)))).)))).))))..,...,|.||||}.,..,..}}}}}.}}}}},}||......{|.||{{{{||{,....,{{{..,..)))},...,{..,,..}})))}}}}||,,..)}||||(((,.(,((....,|}}}..))))))),(({.{,(((((((({.((((({,{.{(....,,.,,(((((.({,(((,,.,||,|||||,},,.,})))||...}))},})).)))))},)))})))..,.}))))}.,}.((((..(((((((((.((((((((..((...({(((((..,(((((((((...((((({({(,,,....}}}),..))))).))))))))),..))))))).,,},...((((((((((((((((((((,.(((..((((....))))..))).}......(((((....((((...)))).)))))((((((((.(((((((......)))))))....{((((((.((((((((...(((....))).....)))))))..).))))))},,(((.((({....)))).})).,,..{{{{...........)))}.......))))))))(((((........)))))))))))))))))).)....)))))))))))))).))))))).))..))))(((((.(((|....}))).)))))....},,,.,,))))))))))).))).)}))))))}}....(((((..((({........(((((...(((((((((((.((((...))))..))){((((.((({...|))).))))}.(((,{,,...((((...))))...),).))).)))))))).....))))){{{({||||||,,,,)),.})))}((((((.(((....)))..)))))).},)..)))))..}}).)))..))))))))))))))).,.....(((((....)))))....((({......))))..,})))))))))).)))))))))).,..)))))))))))))))||,{{|||.....})))},))}))}))}.}}}}.,}})))}}}}})).,.))))}}||..},))||,..{(((((((((((((.......))}})))....)))))))),.})}.}))}.,,||||.....,,}).)))))),,},}},
Forensic Context

No forensic context available.