Basic Information

Symbol
hsa_FAM120A_0004900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-FAM120A_0078
Host gene
FAM120A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:96238538-96324546 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:93476256-93562264 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-852.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -894.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 653.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((...(((.(((....))).))).(((.......)))(((((((.(((((.(((.(((((...(((((.......((((.(((..(((....)))...)))...((((((((((((.(.(((.....))).).))))))).)))))......))))...((((((((((((((...(((.......))).....))))))).)))).)))...((((((...))))))........))).))...)))))....))).).)))))))))))..)))).))))).((((((..........(((.(((..((((((((....)))....))))).))))))..(((.((((((((((((.(((((((........(((((....)))))........(((((((((((.(..((.((((((((((.((.((.(((((((((((((....)))).....(((((((((((.(((((((((.....(((....)))(..((((((...((((((.(.((((.((((...................(((((((.....((((((.....))))))....(((.........)))..((.((((...((.(......).))...)))))).))))))))))).)))).).))))))))))))..)..(((((.((((((.((((((((......)))........................(((((((...)))))))...........(((...((.((((((.(((((.((((((((.......((((((......((((((((......((((...(((..((...((((..(((....((....((.(((((.........(((((..((.....)).)))))))))).))...)).....)))..))))..((....)).))..))).)))))))))))))))))).......))).)))))...))))).))...)))))).)))....))))).))))))..))))).....)))))))))((((((((((((..((((.......(((((........))))).(((((((.(((((((.....)))).(((((((....))..)))))))).)))))))...((.....)).)))).)).))))))))))..((((.((((.((((..(((((...(((.(......(((((......)))))......).)))...)))))..)))).)))).))))......(((((((.(((((...((((...(((..(((((....)))))...))).....((((.....))))........))))))))).)))).)))...(((((((..(.((......)))..)))))))(((.(((((((((....(((((.(((((.........(((((.((((((((.....)))))(((((.(.(.((....)).).)))))))))..)))))...((((........((((..(((((((((.((((((((..((...(((((((...(((((((((...(((((((((.......))))...))))).)))))))))...)))))))...))...((((((((((((((((((((..(((..((((....))))..)))........(((((....((((...)))).)))))((((((((.(((((((......)))))))....(((((((.((((((((...(((....))).....)))))))..).)))))))..(((.((((....)))).))).....((((...........)))).......))))))))(((((........)))))))))))))))))).)....)))))))))))))).))))))).))..))))(((((.((((....)))).))))).))))...))))).)))))...((((((((((..((((((.(((((..(((.........(((((...(((((((((((.((((...))))..)))(((((.((((...)))).))))).(((.(.(...((((...))))...).).))).)))))))).....)))))(((((....((....))..)))))((((((.(((....)))..)))))).)))..)))))..))).)))...)))))))).)))))))).)))))).)))))))))))...(((....))).)))).))).)).)).)).)))))))))).))..).))))))))))).((.(((((.....))))).))((.(((((.((.....))))))).))...)))))))...)))))).......(((....)))....)))))).)))....))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({{.{{{{...(((.(((....))).))).(((,,...,,|||{({{{{..|{|||,|{{.,{(({...(((({.....||||..{((({{.,,,{{{||{{{{|||,,,((((((((((((.(.(((.....))).).))))))).)))),....,|||,|.,,{(((((((((((((...(((.......))).....))))))).)))).))}...((((((,..|}||||,|,||...}}}.}}.},)))))....}}}.}.}}}}}))}})),,}))),))))}.{(({((,{........(({,(((..((,(((((....))}..}})}))).))))}|,.(((.{((((((({{{{.(((({{{....,,..(((((....)))))......,{(((((((((((,(,.((,(({{((((,(,((.{,||}|||||{,((((....}))).....(((((((((((.(((((((((...,,(((....)))}.,((((((...((((((.(.((((.((((..........,,.......{((((((.....(((({(,.,,,}|||}}...,||{,,,.....,)))..{(.((((.,.{({(......}.)).,,)))))}.))))))))))).)))).).)))))))))))).....(((((.((((((.((((((((......))),,,.{{,......,}}..,,....(((((((...))))))).,,......,.(((...((.((((((.(((((.((((({({.......((((({.,..{{(((((((({,,...,,((....||.{{{...((((..{((..,,{{...,{|.(({(,.........(((((..({....,)|.)))}))}}}}.|}...}}..,..)))..))))..||}..{||.,...))).}},)))))))))))},))...}.}})}).)))))...))))).))...))))}}.,,.}}}.))))).))))))..))))).....)))))))))(((((((((({(..((((,......(((((........))))).(((((((.{{{,(((.....)))|,(({{,{,....,}.,}))))}}}.)))))))...{{.....)}.)))).))}))))))))))..((((.((((.((((..(((((...{({.{.{..{.(((((......))))).,..}.},}}....)))))..)))).)))).))))..,,..{({((((.{{{{(...,,{{...{((,.{({{{....}}))}...|||,....,{||,,},.)}}}........}}},))))).}}}}|}}}.},||||{((,.{|((,,,,{{||}..|||||}|(((,({{(((((({{..((((({(({((....,....(((((.((,((({{...,.})))|{{{{,,|||,||....))}}.))}))))),.,)))))...|{{|,.......((((..(((((((((.((((((((..((...({(((((...(((((((((...((((({({(,,,....}}}),..))))).))))))))),..))))))).,,},...((((((((((((((((((((,.(((..((((....))))..))).}......(((((....((((...)))).)))))((((((((.(((((((......)))))))....{((((((.((((((((...(((....))).....)))))))..).))))))},,(((.((({....)))).})).,,..{{{{...........)))}.......))))))))(((((........)))))))))))))))))).)....)))))))))))))).))))))).))..))))(((((.((({....}))).))))).}}}},,,})}}}.}}}))|||{{((((((((,,(({{{{.{((((,.{((,........({{{{...((({(((((((.{(({...)))),.)))||||(,(({,...|||},|||||.(((,{,,...((((...))))...),}.))).)))))))).....)})))|,{{|,||}}}}}}.)},.,)))}{{{{{{,{||,,..)))..)))))).,,},.}}}||{{|,,.,))}}}}})))))).)))))})).,,,}}}.)))))))))))...(((....))),}))),)))})).,)})),}))))))))),)),.),)))))))))))}((.(((((.....))))).))||}||||,|||...,,))))))),)).,.)))))))...))))))....,,{(((,,,,|||....}}}))),)))....)))))),,
Forensic Context

No forensic context available.