Basic Information

Symbol
hsa_FAT3_0005600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-FAT3_0080
Host gene
FAT3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
11:92098928-92099597 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:92365762-92366431 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-190.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -203.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 177.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...)((............(((((...)))))....(((((.(((....(((....((((((((((((....((((.........))))....)))).))))))))....)))....))))))))........(((((((.((((.(((((..........((((...(((((......)))))..)))).............((.((((.(((....)))))))))...(((((..((((((((((.(((((((.((((((.(..(((((.(((...((.(((.((....)).))).)).))).))))).).))))))(((((....)))))(((.((..((((.((.(((((((.(.((((((......)))).)).).)))........)))).))))))..)).)))))))))))).....)))))).......))..)))))......))))).)))))))))))..((((((((((((.(....((...(((((((......)))))))((((((((((..........((((.((......))..)))))).))).))))).........((((...((....))...))))(((((.((.((((((.(((.............)))..)))))).)))))))))..).))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,{((....,.{,{{..((((,...|||||.,,,({,,,.|||..}}|||....|||,,,,|||||}},.||||},..{{.{{|||||,,|)))}.||,|||||.,.{|||{...,,,,))))}..}}}},((((((,{((((.{((((..........{{,,...(((({......))))).,||||.....,....,..((.((((.(((....)))))))))...(((((..{{{(((((((.(((((((,((((((.{..(((((.{{,..,((,({{.||,,..,}.}}}.},.})),))))).}.))))))(((((....))))),((.((..((((.((.(((((({.,.((((((......}}}}.}}.),))),,,,....)))).))))))..)).))))))))))))}....))}})).......))..)))))......))))}.)))))))))))..((((((((((({,|,,,,||,..(((((((......))))))}{((((((({{.,.,,{,,..||||.,{,,},,,}}..,,,,}},))).}))))........,((((...((....))...))))|((((,({.((((((.(((.............)))..)))))).))))))},...}.))))))))))))}}
Forensic Context

No forensic context available.