Basic Information

Symbol
hsa_FAT3_0006100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-FAT3_0119
Host gene
FAT3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
11:92154179-92156512 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:92421013-92423346 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-682.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -729.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 491.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.((((..(((((.......(((((((((((..(((((..(((....)))..))))).(((....)))((((((.............))))))....(((.(..(((....)))..).))).............(((((......(((((.(((.((.......)).)))..)))))......))))).((((((..(((((........))))).))))))..(((.(((((((((.....))))))))))))......))))))))))).........)))))...)))).)))))))))).)(((((((.............))))..((((.(((((((.......))))))).))))...((((((((.....((((.....))))......))))))))(((((..((((((((((((.......)).))))))).))).)))))...................(((.(((..(((((..((((((((((((.(((((((.(((..(((((((((.((.((((((((((....((((....)))).(((((((((.((..(.((((.((((......))))..)))).)..)).))))))))).(((((((((((..(((((.............))))).))))))))))).(((((...((((.........))))((((((...(((((((.((.((.((((......((((((((.((((.(((......))).)))).)))).)))))))).)).))))))))).)))))).)))))..((((...))))((((..((((((.(((.(((.((((((((..(((..........))).))))))))))).))).))))))))))..........(((((..((((..(((((((((.((....))..))))))))))))).......((((..((.(((...))).)).))))((((.((.((.((.((((((((...(((..((((...))))..))).)))))))))).)))).))))...(((((....))))).(((.(...((((((......))))))).)))...(((((((....(((((((((((((.((((((((((((((((((((..((((((((..((.....((.(((((((.(((.((.((((((((.....(((((((.((((...................................(((((((((((((((((.(((......(((......)))((((((((((((((........((((((.(((..((.....(((((.((((((((((((((((((.((((((..((((((((((((.(((((((((...)))))(((.(((((.....))))))))(((.(((.(((((((......))))))).)))))).((((((((((..((((((((((((((((........((((...))))(((((((((.(((...........))).)))))))))))))))))..))))))))........)))))))))).......(((((....))))))))))))).))).)))))....)))).)).))))))))))).)))).))).)))))........))..))).)))))).....)))))).)))).)))).........(((((((((((((..(((((.....(.(((((((((.........)).))))))).)))))).)))))))))))))...)))....))))))))))..)))))))(((((.((((..((......)).)))).)))))(((....))).(((.(((((.(((.(.((((...)))).).))).))))).)))...((((.((((((((((...(((.(((....))))))...(((((((.((....)).)))))))...........)))))).))))))))...)))).)))))))...))))))...)).)).)))...(((((......)))))..(((.((((((.......)))))).))).........))))))).))))..))))))))...)))))))))))))))))))).)))))))))))))....))))))).....)))))((((((..(((((((.((((........))))....))))))))))))).))))))....)))).)).)))))...))))))).))))...))).))))))))).))))))))..))).)))..((((((((.((((..((..........................)))))).)))))..)))......)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({({{{{{,(({{..(((({,.,,...(((((((((({..{((((..(((....)))..))))).,{|....}},((((((.............)))})),.{{(((.{..{{{....}},..,.},}.,|{{{{...,}}|{((({.....(((((.(((.((.......)).)))..)))))....},}}))}.((((((..(((((........))))).))))))..(((.(((((((((.....))))))))))))......})))))))))}.........}}}},...)))).)))))))))).}{,,{{{{..,.......,..})))..{(((.(((((((.,...,.))))))).)))}..,((((((((,{{,.((((.....))))...,},))))))))|{{{{..{{{(((((((((.......))}})))))))})}.}}))}.........}}|,..,,..{{{,(((,.(((({.,((((((((((((.(((((((.(((..{((((((((.((.((((((({((..,.((((....))}|,{{(((((((,{{..,.,,,,.||||},,,,.}}|}..|}||{{{{||.}}}}}},...(((((((((({..{((((..,......,}..))),}.,)))))))))).{{{{({{{,,,,,}},.,,,,||,,((((((.,,({{((((.,{.((.{(({......,((.((((.((((.(((......))).)))).)))).))))}))).)).,,))))))).)))))).)))))..((((...))))((((..((((((.(((.(((.((((((((..(((..,.......))).))))))))))).))).))))))))))..,.......,,,,...((((..(((((((((.((,...}},.))))))))))))),{,.{..,,,|}.||},,|..,)}}||..,,))||||,(({,({(({((((((((...(((..((((...))))..))).)))))))||,{|||,.,||....((((,....}))))}|||}}.}}((((((......)))))))})))}}}||(((((....(((((((((((((.{(((((((((((((((((((..((((((((..({.....{{.(((((((,(((.,(.(((((((((((({,{,{..,,}}}}}},...,,,,,..,.,,,,||,.............(((((((((((((((((.{,(.{{{..{((......))}((((((((((((((.....,,.{(((({.(((..((..,..(((((.((((((((((((((((((.(((((({,{{{(((((((((,(((({((({...}}|||((,,(((((.....))))))))|((.(((.((((((({....,))))))).))))),.((((((((((..(((((((((((((((({.....,.((((...)))),{(((((((.(({...........))).)))))))))))))))))..))))))))........}))))))))).......(((((....))))),))))))),})).))}}.....)))).)).)))))))))))},))).))).)))))...,,...))..))).}))))}.},..)))))).)))),,))).........(((((((((((((..(((((,....{.((((((({{.........)}.))))))).)))))).)))))))))))))...))).,,.)))))))))}..)))))))(((((.((((..((......)).)))).))))){{{....}}}.(((.(((((.(((.(.((((...)))).).))).))))).))).,.{((,{((((((((((...,,(.{{({,,,}}},,,,,,((((({{.{{...,)),})))))}..,,,,.....)))))).)))))))}((({{{(....))))))..,|.,....)),,,.))),..||||{......}}}||..(((.((((((.......)))))).)))..,,.....))))))).}}})..))))))))...)))))))))))))))))))}.)))))))))))))....))))))),,,}}},.,.((((({.,(((((((.((((........))))....))))))))))))).}}}))}....)))).)).)))))...)))}))).)))),..))).))))))))).))))))))..))}.}}}..||{(((((.((((..{{..........................,,)))).)))))..)))...,,,)))
Forensic Context

No forensic context available.