Basic Information

Symbol
ABCA12
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily A Member 12 LI2 ATP-Binding Cassette, Sub-Family A (ABC1), Member 12 Glucosylceramide Transporter ABCA12 ATP-Binding Cassette Transporter 12 DKFZP434G232 ICR2B Ichthyosis Congenita II, Lamellar Ichthyosis B ATP-Binding Cassette Sub-Family A Member 12 ATP-Binding Cassette 12 EC 3.6.3.25 EC 7.6.2.1 EC 3.6.3 ARCI4A ARCI4B ABC12
Location (GRCh38)
2:214931542-215138626
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_173076.3
Sequence length
9298.0 nt
GC content
0.4256

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2556.84 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2738.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2717.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015657.4 NCBI
AUUUCCUAUAAAUAUCACAAAUAUUUCCAACAAAAGAGCAUAGAUGUCU… 8085 nt 0.4220
NM_173076.3 NCBI
GUGGAUAGGCAAUUAAUUUCAUGGAGAGUAGGAGGUGUGGGUUCAGCUG… 9298 nt 0.4256
Summary

The membrane-associated protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intracellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, and White). This encoded protein is a member of the ABC1 subfamily, which is the only major ABC subfamily found exclusively in multicellular eukaryotes. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ABCA12 transcript, an ATP-binding cassette transporter involved in molecular efflux, increased in abundance within 0.5 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].