Basic Information

Symbol
CMSS1
RNA class
mRNA
Alias
Cms1 Ribosomal Small Subunit Homolog C3orf26 Protein CMSS1 MGC4308 Cms1 Ribosomal Small Subunit Homolog (Yeast) Chromosome 3 Open Reading Frame 26
Location (GRCh38)
3:99817837-100181732
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032359.4
Sequence length
4302.0 nt
GC content
0.4514

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1287.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1370.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1137.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001167924.2 NCBI
AGUGUCACAGGAGACACGAGGGCAAAGUGCUGAGGAAACUCUAGAGCAA… 4186 nt 0.4448
NM_032359.4 NCBI
AGUGUCUAGCGGGAGCUCCGCGUGUAGCUACGCCGGCCGCCUGGCUUUG… 4302 nt 0.4514
Summary

Enables RNA binding activity. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CMSS1 was part of a significantly overexpressed co-gene set independent of cell type and sample group during post-mortem interval analysis [Guo et al. DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147708].