Basic Information

Symbol
CNDP1
RNA class
mRNA
Alias
Carnosine Dipeptidase 1 CPGL2 CN1 Glutamate Carboxypeptidase-Like Protein 2 Beta-Ala-His Dipeptidase HsT2308 Carnosine Dipeptidase 1 (Metallopeptidase M20 Family) CNDP Dipeptidase 1 Serum Carnosinase Carnosinase 1 MGC10825 EC 3.4.13.20
Location (GRCh38)
18:74534400-74587212
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032649.6
Sequence length
4342.0 nt
GC content
0.4486

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1278.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1362.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1431.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032649.6 NCBI
AGAUGUGAAUAGCUCCACUAUACCAGCCUCGUCUUCCUUCCGGGGGACA… 4342 nt 0.4486
Summary

This gene encodes a member of the M20 metalloprotease family. The encoded protein is specifically expressed in the brain, is a homodimeric dipeptidase which was identified as human carnosinase. This gene contains trinucleotide (CTG) repeat length polymorphism in the coding region. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the CNDP1 is a Lrap-influenced transcript associated with alcohol consumption, showing a positive correlation with alcohol consumption and a negative correlation with Lrap expression, with its sum of isoforms significantly increased in Lrap knockout brains [Saba et al. DOI:10.1111/Gbb.12698].