Basic Information

Symbol
CNNM4
RNA class
mRNA
Alias
Cyclin And CBS Domain Divalent Metal Cation Transport Mediator 4 KIAA1592 SLC70A4 ACDP4 Ancient Conserved Domain-Containing Protein 4 Metal Transporter CNNM4 Cyclin-M4 Ancient Conserved Domain Protein 4 Cyclin M4
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_020184.4
Sequence length
4783.0 nt
GC content
0.5557

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1852.54 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1938.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1026.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((((((.(((((((((((((((((((((((....))).(.((((((...)))))).)(((((((((((.(.(((((((.(((((((((.(.((((((((.((((.(((((((..(((((((((....))))))...)))..))))))).)))).))))))))))))).))))).))))))).).)))))((((...((((((((((..((((.(((((((((((((((((.(((.....))).))))..........(((((.((((.....)))).))))).......))))))))...(((((((((((((.(((.((((((((....)))))))))))...((((((((.(....(((......)))....).)))).))))..((((.(((((((.(((((((((((((((.((.((((((....((((.(((.((...)).)))))))...))))))))..(((.....))))))).)))))))).)))......((((((....))))))((((((((((..((...((..((((.(((((((((((........)))))).)).....))).)))).)).))..))).)))))))....)))))))((((.(((((((....))))))).))))......))))....)))))))))))))..)))))..)))).....))))))))))..))))(((((...))))).((...((((((..((((((...))))))..))))))..))(((((((((..((.((.((((((...(((.(....))))))).))))).))..)).))))))).((((((((.(((.(((((..(((........))).)))))....((((((..((.((.....(((((((((((((((..(((....)))(((((((.(((.((((((((((((...((((...(((.((...(((((((((..((((((((((((((((.((((((((....))))(((((..................(((.((((((((((((.(((((((((((....((.(((((((((.(((......)))))))))).)).))..((....))...))))).)))))).)).).....)))))))).).)))..((((.(((((((......))))...))).)))).((((((....)))))).((((((.......)))))))))))..))))..)))))(((((((..((.((.((.....))..)).))..)))))))........))))))))).))..))))...((((......)))).....((((((((....))))))..))......(((((.....)))))(((...)))..)))))..))))))))))))))).(((((...................................)))))((((((((......))))..))))..))))))))).))))))).....((((((((...((.(.(((.(((.((((..............)))).))).)))).))))))))))..)))).)).)))))))))(((((((..((((.((.((.((((..((.........))..)))).)))).))))..))(((......))).(((....)))....)))))...((((((.((....))..)))))))).))..))))))..))))))))))).............))))))))))))))....))))))))..)))).))(((((.(((((((((((.(..((((.......))))..).)))))....))).))).)))))...............((((..(..(....)..)..))))...........((((.................))))...........)))))))))))...............(((.(((((((((((((((.(((((((((..(.((..(((..(((..((((.((...)).))))..))))))...)).)..))))).)))).)...))))).))).)))))).)))........((((((..(((.(((.(((..((((((((((.((((..((.(((.........)))..))..(((((((((((((.(((..(((...)))..))))))).(((((((((....(((((..(((((..(((..(((((((((((....(((((...(((.(((..((((((((((((.((.....))))))))((((((((.....))))..))))...(((((.((((....(((((...)))))..)))).)))))..))))))..))))))))))).((((((.......)))))).(((........)))...........(((......)))...)))))))..))))....)))....((((((((((.(((((((.......)))))))...))))...))))))...)))))..)))))..)))...))))))........(((((((.....)))))))........(((((((..((((((.....)))))))))))))..)))))))))...)))).)))))..))))).))).(((((((....)))))))))).)))))))))(((..((.(((.((((((((((((((((((((((((.....)))...((((((((........((((((((......))))))))((((......((((.(((((...(((((.......))))).....)))))...))))......(((((((((.......((((..(((.((..((((((((.(((...(((....))).....))).)))))))).)).))).)))).....))))))))).(((((((((......))))).)))))))).))))))))))))))))(((..(((((.(((((........))))).))))))))............((((..(((..(((((((((((((.(.((.(((.((((............)))).))))).).))))..)))))))))..((((......))))..((((.(.(((((((..((..((....))..))..)))).))).))))).........)))))))))))))))(((((.(.(((((((.(((((((((.(((....))).((((.((((((((((.((((((((((.......((((((.......)))))).....(((((...((((((((((((((....(((....)))..))))......))))))))))..)))))....(((((((.((((((..((((((((((((..(((..(((((.((.(((((((((...(((((((((....))))))))).....(((((((((((.((((.......))))......(((((((((.........((((((((....)))).))))(((((((((..........((.........))..........))))))))).....)))))))))(((..((((((((((.(((((.(..(....)..).)))))))))))))))..)))((((.(((.((((((.....))))))..))).))))..((((..((..((((((((((((((.........(((.((((...)))))))(((((......(((((..(...)..)))))))))).....(((((((((((..((((..(((((...)))))..)))).((((((((((((..((..((((((((((..((......(((((((..(((((.((((.(((((.(((.(((.(((((((....))))))).))).((((((((........)))))))).((((((((.(.(((((((((((((((..(((.(((((.((((......)))))))))))).....(((.((.....)).)))....((((((.((....((.((((..((((((((((.((..((((.((((((...))))))((((((...(.(.(((.....))).).)...)))))).(((((((.(((......))).))).))))))))..))..))))))))))..((((....))))...)))).)).....)).))))))...))).)))).)))))))))))))))))(((....)))..))).)))))))))(((.(((.(((.(((((....))))).))).)))...))).....)))))))))))))).)))))))....))).))..)))..))))))))).....))))...)))))))((((((((((.......))).....))))))).(((((......)))))...))))))))).)))))....)).))))((((...(((((......)))))..))))..................)).))))))))).......))))).))))....)).)))))...........((((((((.((((((...))).))).))))))))......))).))))))))).))).)))))))))))))))))))))...)).))))).))))))))).))))(((((....((..(((((.(((((..........)))))..)))))..))...)))))...)))))))))))).).)))))..((((((((.......(((((.(....).)))))))))))))...)))))..))).))..)))....(((.(((((((..........))))))).)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.((((((.((((((((((((((((((((((,,.((,(({({(((((({......))}),,,...(((((.(.(((((((.(((((((({,(.((((((((.((((.(((((((.,(((((((((....))))))...)))..))))))).)))).))))))))))))).))))).))))))).).))))),((({({((((((((((.,((((.((((((((((((({(((.(((.....))).)})),.,.......(((((.((((.....)))).)))))..,....))))))))...(((((((((((((.{((.((((((((....)))))))),))...,,{{{{((,{....||{...,,,|||,,..|,||||,}}||..(((,.{|||{{|..|||||||(((({{,.,(,{{{{((,,..{{{{,|||.||,,,||||||})},.,,|||}}|||,.||,.,,,,))))))},)))))|||.,}},,},..((((((....))))))((((((((((..((...{,..((((.(((((((((((........)))))).)).....))).)))).},.))..))).)))))))...,)))))))((((.(((((((....))))))).))))......,},,....)))))))))))))..)))))..)))).....})))))))),..,}})))))},..)))))))).,}((((((..((((((...))))))..))))))..,,(((((((((..((.((.((((((...((,.{....})))))).))))).))..)).))))))).((((((((.(((.(((((..(((........))).)))))....{(((((..((.{,...{{(((((((((((((,,..|||{{{{|,{((({(((.{{.((((,,.||||,,..,||||,}.,,|}||}..(((((..((.{(((((((((((((({({((((((((....)))){((((...............,,,(({.((((((((((((,(((((((((((....((,{.(((((((.(((......)))))))))).}}.))..,(,....},,.)))))))))))).)).).....)))))))).).}))..,|||,{||{(((.,....)))),..}}}.,,}}.((((((....)))))).((((((.......))))))))))},,|||{{.,|||}({{{{|{,}|{.||,||,,.,}))},}}.)),.}}}))),........)))))))))})}....(({..((({......}))).}}).{,((((((....)))))).,|,.....,(((((.....)))))|,,...}))..)))))..,}))))))))))))},{{{{{.......{{,....,{{{{{{{{{,..........)))}}|,..{(((,,,,..}}|},,,.},,{|,|||||}|{|}}||||.,,{.((((((((...((,{.(((.(((.((((.......,,.....)))).))).}))}.}}))))))))..)))|})},,)))})))}}},}}||}}||||{(({((.,,,.}}||}}...{{{{{{..||,,.,,.)},)))}}).,|,.|,||,.|..{{{....}))}})}))))))},((((((.((....))..)))))),}.))..))))))..))))))))))),{,...,}}....,},}))))))))))....))))))))..)))).))(((((.((((((((((((,..((((.......))))..,..)))},)).))).))).))))),,..{({.{{..{{.,,...}|.}|.}},...},.||,||.|,.......||{|...,,..,.........}},,...........)))))))))))...............(((.(((((((((((((({.(((((((((..{.((..(,,..{((..((((.((...)).))))..)))|}}...}).}..))))).)))).}...))))),})).)))))).)))........((((((..(((.(((.(((..((((((((((.((((..((.{{(..,...,..})),.},..((((((((((({{.{||..{((,,,,||,,|||||||{(((((({{{....(((((..(((((..(((..(((((((((((....(((((...((,{(((..((((((((((((.((.....))))))))((((((((.....))))..))))..{(((((.((((.,..(((((...))))).,)))).))))),)))))))..))))))))))).((((((.......)))))).{,{........}||.,........,||{......}))...)))))))..))))....))).,..(((((((((({((((,((.......)))))))}},)},,...)))))).,.)))))..)))))..})),..)))))}...,....{||||||...,.)))))})}}}}....(((((((..((((((.....)))))))))))))..)))))))))...)))).))))},,})))).))).(((((((....)))))))))).))))))))){({,,{,.(({.{((({((((((({..,((((.((({...,)))..))))|{{,{.,,.{{{{(({{({{(,,...,||||||||||||{|,,,((({({(((({{{{{.,,,...,,,,,....,}))})||||............,,}}}}}||||||||}|.}}}(((,({((..,((((,.,|.(({{{({.(,{(((({....,,{.(((((((((((({{,{((((....})))},,{{{({((,(((((......))))).)))|..,,,{(((((.{,...),))))}}.{((({.{((((........))))).))))),||............})}.,))}},.(((((((((((((.{.((.(((.((((............)))).))))).).))))..))))))))).))))))))))))))....,}},)))}}}|,|.})}}}}.,,.,},})))...))))...)))|}}..,,,....})))),,}))))))}(((((.(.((((({{((((((((((.(((....))).(({((((((((((((.((((((((((......,((((((.......)))))),....(((((...((((((((((((((....(((....)))..))))......))))))))))..)))))....(((((({{((((((..((((((((((((..(((..(((((.((.(((((((((...(((((((((....))))))))).....(((((((((({.((((.......))))......(((((((({.........((((((((....))))}})))(((((((((..........({.........}}..........))))))))).....}))))))))(((..((((((((((.((({{,({.,....,..)})))),))))))))))..)))((((.(((.((((((.....))))))..))).))))..{(((..{{..((((((((((((({.........(((.((({...})))))),,,,,..,{{,({({{,.{...,..)})))})))|,,,.,(((((((((((,.{(((..(((({...)))))..)))),((((((((((({..,{{{((((((((((..{{......(((((((..(((((.((((.(((((.(((.(((.(((((((....})))))).))).((((((((......,.)))))))}.((((((((.(.(((((((((((((((..(((.((((,{((((......,)))))))),)),.,..{((.{{.....}).)))....((((((.((....((.((((,,((((((((((.,({{((((.((((({...})))))((((((...(.{.(((.....))).).,...)))))).(((((((.(((......))).))),,))))))).}))..))))))))))..((((....)))),,.)))).)).....)).))))))...))).)))).)))))))))))))))))(((....)))..))).)))))))))(((.(((.(((.(((((....))))).))).)))...))).....)))))))))))))}.)))))))}}}.),}....,)}}..))))))))).....))))...)))))))|{({{{{,{{.,.....}}),...,)))))}}.,((({...,,,.,,}))..)))))))))},))))....)}.)))}((((...(((((.....,))))),.)))).......,,,,,...,..)).))))))))).......))))).)))).,,.,,)))}),...........((((((((.((((((...))).))).))))))))......))).))))))))).))).))))))))))))))))))))}..,)).))))).))))))))).))))(((((.,..((..(((((.(((((........,.)))))..)))))..))..,)))))...)))))))))))).).)))))..,{{{{{{{.,,,,..{{{{|.|....},)))))}}}})))),,,)))))..))).},..)))....{({.(((((((..........))))))).})).,....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUUGGCUCGGCGGCAGCGGAGCGGCCGGAGCUGCGGUGCGGACCGGGG… 4783 nt 0.5557
Summary

This gene encodes a member of the ancient conserved domain containing protein family. Members of this protein family contain a cyclin box motif and have structural similarity to the cyclins. The encoded protein may play a role in metal ion transport. Mutations in this gene are associated with Jalili syndrome which consists of cone-rod dystrophy and amelogenesis imperfecta. [provided by RefSeq, Feb 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.