Basic Information

Symbol
CNOT6L
RNA class
mRNA
Alias
CCR4-NOT Transcription Complex Subunit 6 Like Ccr4b Carbon Catabolite Repressor Protein 4 Homolog B CCR4-NOT Transcription Complex Subunit 6-Like DKFZp434K098 CCR4-NOT Transcription Complex, Subunit 6-Like EC 3.1.13.4 CCR4B
Location (GRCh38)
4:77713387-77819615
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_144571.3
Sequence length
8772.0 nt
GC content
0.3602

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2225.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2398.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2382.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001387842.1 NCBI
GUGUGUGUUUCCCCUGCCGCGGGGAAAUGGCUGCUGUUGCUUCUGGGCC… 8955 nt 0.3615
NM_001387843.1 NCBI
GUGUGUGUUUCCCCUGCCGCGGGGAAAUGGCUGCUGUUGCUUCUGGGCC… 9026 nt 0.3632
NM_144571.3 NCBI
GUGUGUGUUUCCCCUGCCGCGGGGAAAUGGCUGCUGUUGCUUCUGGGCC… 8772 nt 0.3602
Showing 11 to 13 of 13 entries
Summary

Predicted to enable 3'-5'-RNA exonuclease activity. Involved in positive regulation of cell population proliferation and positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly. Located in cytosol and nucleus. Part of CCR4-NOT complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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