Basic Information

Symbol
CNTLN
RNA class
mRNA
Alias
Centlein BA340N12.1 C9orf101 C9orf39 Centlein, Centrosomal Protein Centrosomal Protein OTTHUMG00000019597 FLJ20276 Chromosome 9 Open Reading Frame 101 Chromosome 9 Open Reading Frame 39
Location (GRCh38)
9:17134982-17503923
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017738.4
Sequence length
5518.0 nt
GC content
0.3896

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1293.64 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1406.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1389.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001114395.3 NCBI
AACUUGACCCGUUAGCAGCCGCAGCCAUGGCGGCGCGUUCGCCUCCCUC… 4866 nt 0.3742
NM_001286984.2 NCBI
AACUUGACCCGUUAGCAGCCGCAGCCAUGGCGGCGCGUUCGCCUCCCUC… 2229 nt 0.4078
NM_001286985.2 NCBI
AACUUGACCCGUUAGCAGCCGCAGCCAUGGCGGCGCGUUCGCCUCCCUC… 2040 nt 0.3828
NM_001365029.1 NCBI
AACUUGACCCGUUAGCAGCCGCAGCCAUGGCGGCGCGUUCGCCUCCCUC… 5515 nt 0.3895
NM_017738.4 NCBI
AACUUGACCCGUUAGCAGCCGCAGCCAUGGCGGCGCGUUCGCCUCCCUC… 5518 nt 0.3896
Summary

Enables protein domain specific binding activity; protein kinase binding activity; and protein-macromolecule adaptor activity. Involved in centriole-centriole cohesion and protein localization to organelle. Located in cytosol; microtubule organizing center; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

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