Basic Information

Symbol
CNTRL
RNA class
mRNA
Alias
Centriolin CEP110 CEP1 Centrosomal Protein Of 110 KDa Centrosomal Protein 110kDa Centrosomal Protein 1 BA165P4.1 (Ortholog Of Mouse Ma2a8) BA165P4.2 (Centrosomal Protein 1) Centriole Associated Protein 110 KDa Centrosomal Protein BA165P4.1 Cep110 FAN
Location (GRCh38)
9:121074660-121177729
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007018.6
Sequence length
7719.0 nt
GC content
0.4280

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2033.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2177.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1973.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330762.2 NCBI
ACUCUUGGCCAAGAAUGUGGUUUGAGGCUCUGCGAAGUUACAGAGGCUC… 5934 nt 0.4383
NM_001369892.1 NCBI
ACUCUUGGCCAAGAAUGUGGUUUGAGGCUCUGCGAAGUUACAGAGGCUC… 5793 nt 0.4367
NM_001369893.1 NCBI
AACCGGCACAACACAACAAAAUGGCUGCCGCGCCGCUGGGCCCCUGAGG… 5456 nt 0.4194
NM_001369894.1 NCBI
AACCGGCACAACACAACAAAAUGGCUGCCGCGCCGCUGGGCCCCUGAGG… 5462 nt 0.4160
NM_001369895.1 NCBI
AACCGGCACAACACAACAAAAUGGCUGCCGCGCCGCUGGGCCCCUGAGG… 5498 nt 0.4254
NM_001369896.1 NCBI
AACCGGCACAACACAACAAAAUGGCUGCCGCGCCGCUGGGCCCCUGAGG… 1695 nt 0.3735
NM_007018.6 NCBI
AACCGGCACAACACAACAAAAUGGCUGCCGCGCCGCUGGGCCCCUGAGG… 7719 nt 0.4280
Summary

This gene encodes a centrosomal protein required for the centrosome to function as a microtubule organizing center. The gene product is also associated with centrosome maturation. One version of stem cell myeloproliferative disorder is the result of a reciprocal translocation between chromosomes 8 and 9, with the breakpoint associated with fibroblast growth factor receptor 1 and centrosomal protein 1. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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