Basic Information

Symbol
COA8
RNA class
mRNA
Alias
Cytochrome C Oxidase Assembly Factor 8 C14orf153 APOP-1 APOPT1 Apoptogenic 1, Mitochondrial MGC2562 APOP1 Chromosome 14 Open Reading Frame 153 Apoptogenic Protein 1, Mitochondrial UPF0671 Protein C14orf153 Apoptogenic Protein 1 Apoptogenic 1 MC4DN17 APOP
Location (GRCh38)
14:103562960-103607523
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001370595.2
Sequence length
1234.0 nt
GC content
0.4959

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-410.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -434.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 319.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001302652.2 NCBI
GCAAUGCUGCCGUGCGCCGCGGGAGCCAGGGGGCGUGGGGCCAUGGUGG… 1235 nt 0.4955
NM_001302653.2 NCBI
GCAAUGCUGCCGUGCGCCGCGGGAGCCAGGGGGCGUGGGGCCAUGGUGG… 1325 nt 0.4974
NM_001302654.2 NCBI
GCAAUGCUGCCGUGCGCCGCGGGAGCCAGGGGGCGUGGGGCCAUGGUGG… 770 nt 0.4883
NM_001370595.2 NCBI
GCAAUGCUGCCGUGCGCCGCGGGAGCCAGGGGGCGUGGGGCCAUGGUGG… 1234 nt 0.4959
Summary

This gene encodes a protein that localizes to the mitochondria, where it stimulates the release of cytochrome c, thereby promoting programmed cell death. Mutations in this gene have been found in individuals with mitochondrial complex IV deficiency. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Nov 2014]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in post-mortem human blood samples demonstrated that the COA8 (APOPT1), a gene initiating apoptosis by triggering cytochrome c release, was included in an up-regulated cluster and exhibited a positive coefficient in a generalized linear model with elastic net restriction designed for post-mortem interval (PMI) prediction [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z]. This model, developed from 30 RNA transcripts, achieved a root mean square error of 4.75 hours, indicating its potential utility as a transcriptional biomarker for PMI estimation.